治疗主要是以抗病毒治疗为主。有潜伏期、爆发期、疱疹期、愈合期四个时期，疱疹型咽峡炎存在着一定的潜伏期，并不是当场突然患病，潜伏期大概是2到4天的时间，还有的少数人的潜伏期是俩周左右，发病时间就在春秋两季比较高，临床表现是发热、咽痛、咽峡部粘液小疱疹和浅表溃疡。
疱疹性咽峡炎前期由水痘，带状疱疹病毒引起，多发生于高烧以后，浑身出红点，此病毒一般潜伏在脊髓后根神经元中，还会伴随机体抵抗力低下或劳累，感染，感冒发烧，生气上火。
疱疹性咽峡炎是一种常见的感染性疾病，一旦确诊，就需要按照以下程序处置：
1.勤洗手，注意饮食卫生。
2.加强患儿的护理，保持适宜的室内温度和湿度。
3.给患儿多喝水，降低患儿的体温，避免体温过高引起惊厥。
4.除了口腔局部用药外，还应给患儿口服抗病毒的药物，可选择小儿豉翘清热颗粒、连花清瘟颗粒等，促进患儿的好转。
通常情况下，小儿疱疹性咽峡炎吃半流或者流质食物、维生素丰富的食物比较好。具体分析如下：
疱疹性咽峡炎是由肠道病毒引起的以急性发热和咽峡部疱疹溃疡为特征的急性传染性咽颊炎，以粪-口或呼吸道为主要传播途径。小儿疱疹性咽峡炎建议给予清淡饮食，予以半流或者流质食物，如白粥、面条、馄饨、藕粉等，有利于病情恢复，还应进食蔬菜等维生素丰富的食物，比如胡萝卜、菠菜、芹菜等。
一般情况下，宝宝疱疹性咽峡炎需要通过多个方面进行护理。
宝宝疱疹性咽峡炎需要通过注意休息、室内多通风、多给宝宝饮水，宝宝应养成勤洗手的习惯，少到公共场所，不要随意使用抗生素。当宝宝出现不适症状时，家长应及时带儿童到正规医院进行确诊及治疗，同时要注意吃清淡比较容易消化的食物，多吃蔬菜、水果，应少量多次进食容易消化的流质、半流质食物，如米粥、面汤、果汁、菜汁等。
小儿疱疹性咽峡炎的症状可能会有以下症状：
疱疹性咽峡炎是由肠道病毒感染引起的急性上呼吸道感染性疾病，具有传染性，好发于6岁以下学龄前儿童，起病急，常出现发热、咽痛、口痛、咽峡部疱疹等症状，通常以对症治疗为主。但个别患者可能出现脑炎、心肌炎等严重并发症，甚至导致死亡。
该病为自限性疾病，多数患者可自行痊愈，预后良好。
