碘酊具有强大的杀菌作用，一般取2%浓度用于注射部位皮肤消毒或早期疖肿的消炎，但有较强的刺激性、腐蚀性，所以用于皮肤消毒后应以70%酒精擦拭脱碘，且禁用于黏膜或伤口内消毒，否则会引起剧痛和红肿。因此碘酊脱碘的原因就是碘酊有较强的刺激性、腐蚀性，并且有些患者对碘过敏，用后及时脱碘可以防止碘造成过敏。
给宝宝脐带消毒时，较常用的是碘酒，碘酒的挥发性、刺激性小，每天消毒两次早晚各一次。也可以用碘伏先消毒，再用酒精脱碘。用酒精脱碘时用棉球在肚脐中心，以转圈的方式向外擦，能够起到脱碘、消毒的作用。
游离状态的碘和酒精的混合物。其消毒作用的原理是游离状态的碘原子的超强氧化作用，可以破坏病原体的细胞膜结构及蛋白质分子。利用碘的氧化作用，其碘是络合碘。碘伏干后，会形成一种类似油性的薄膜。
龟头炎可以使用碘伏外涂治疗，碘伏除杀菌作用，还有一定的抗真菌作用。杀灭能力相对较强，而且碘伏对皮肤黏膜刺激性相对较小，可以用于阴部皮肤外涂治疗。禁忌使用酒精制剂，如碘酒或医用酒精等治疗，因为碘酒及酒精内均含有刺激皮肤黏膜的酒精成分，可引起黏膜疼痛或红肿等现象。
孕妇可以用碘酒消毒，孕妇局部皮肤用碘酒对胎儿无影响，但早孕是一个致畸敏感期，胚胎对致畸因子有显著的敏感期，不同的致畸因子对胚胎致畸类型有明显的特异性，因此妇女在使用药物时必须谨慎。
