传统手术和微创手术。肛瘘的传统手术非常疼痛，特别是术后恢复时间超长，一般需要一个月左右的时间，因此病友间往往用“人间炼狱”来形容肛瘘的手术。因此，很多病者现在基本上不愿意接受传统手术，转而选择创口小、过程无痛、术后恢复快的微创手术进行治疗。
不是只有西医手术可以治疗的，更多的是中医院结合治疗。现在很多中医院都可以治疗肛瘘等肛肠疾病。中医治疗比较缓慢，如果不注重还是会复发的。药物和手术只是一方面，更重要的是从现在开始就做好肛门的护理，便后水洗，坐要悬空透气，养成定期温水熏蒸坐浴的习惯，再加上注意饮食，不要便秘，不要辛辣，才会减少恶化，加速术后康复。
患有肛瘘，药物治疗的效果不是很好，尽量还是手术治疗，可以选择三级以上医院进行手术治疗，术后护理很快就会恢复，通常多喝水，多吃蔬菜水果。少吃辛辣食物，尽量保持大便通畅，防止便秘，不抽烟不喝酒，不熬夜，工作和休息规则。
肛瘘的症状是反复脓性分泌物的排出，瘘管通畅无炎症常不感到疼痛，只感觉局部发胀不适，行走时加重，如外口封闭，瘘管积脓，则有疼痛，排便时加重。肛门周围皮肤受分泌物刺激常感觉瘙痒。
肛瘘术后伤口需要半个月左右时间才能愈合。这是正常愈合的情况下，有的肛瘘炎症不重，术后一周左右也有恢复正常的。有的时间太长，炎症比较重，恢复的时间可能会长一些。术后加强局部的清洁卫生，忌食辛辣刺激性食物，规律饮食按时起居。
