儿童的扁桃体肿大，主要看临床表现以及症状。如果症状很明显，需要进行手术治疗，症状包括反复发炎、呼吸困难、睡眠打鼾或者吞咽困难、言语不清。如果反复发现或者进行性加重，只有一个办法是行扁桃体切除术。
发热应予紧急处理，采用冷敷和拭浴的方法，使尽快降温。可用冷湿毛巾敷额，好可用不漏水的塑料袋盛冰块外裹干毛巾敷头、颈。若加敷腋窝和腹股沟则效果更好。早晚用淡盐水漱口，以能感到微咸为宜。
早期症状不明显，仅咽喉不适、异物感或轻微疼痛。晚期可用于明显的咽部疼痛、吞咽加重、同一侧胸膜或面部放疗。经常有口臭、出血和张嘴困难。外侧扁桃体明显肿胀，结节状或花椰菜状，或表面溃疡，坏死和假膜。
儿童的扁桃体肿大常常会引起睡眠时打鼾，也就是打呼噜，导致晨起乏氧、犯困、注意力不集中、没有精神头。如果扁桃体反复发炎，还容易引起其他的相关疾病，比如心肌炎、肾炎、关节炎等。
小孩3岁扁桃体肿是由于儿童淋巴组织比较丰富，可能会引起扁桃体生理性的肥大，在成年之后扁桃体可能会有所缩小。可以进一步做局部病理检查或者淋巴结的病理检查，进一步看是否有血液疾病引起的扁桃体肿大或者增生。
小孩子咳嗽和扁桃体肿大是两个疾病，如果咳嗽久治好不了，需要排除鼻窦炎引起的鼻涕倒流到咽喉部，引起的反射性咳嗽可能。而扁桃体单纯性的肥大，是没有关系的。小孩子的咳嗽如果已经排除了下呼吸道的感染，可以到耳鼻咽喉科，遵医嘱进行治疗。
