在扁桃体隐窝处，会有食物的残渣残留积聚，长时间的不清理，就容易导致细菌感染，细菌的繁殖。久而久之就会形成不容易溶解的钙，镁等无机盐沉积在扁桃体隐窝中，慢慢就形成结石。
扁桃体结石多为急性扁桃体炎反复发作导致扁桃体分泌物排出受阻，导致导管阻塞分泌物潴留所致的扁桃体结石，发现扁桃体结石一般并发扁桃体充血肿胀，要想清除结石，首先要注意口腔卫生，应用口腔含漱药物，局部应用口含片，促进结石排出。
扁桃体结石是由扁桃体上隐窝长期阻塞，致使分泌物引流受限引起。极少数的扁桃体结石会自行脱落，大多数还是需要通过外来器械，摘除结石。如果张嘴就可以明显看到扁桃体结石，可以使用镊子夹取出来。
治扁桃体结石可能是咽部疾病，给予检查，以明确诊断，给予对症治疗，扁桃体出现结石是由于长期，慢性的扁桃体炎导致的钙化，出现这样的问题还是应该尽早的切除扁桃体。
扁桃体结石是一种细菌感染的疾病，平时一定要保持自己的口腔卫生，坚持刷牙，并且在吃饭之后一定要漱口，将口中的一些残渣清除干净，一定要保持个人的卫生干净，一定不要刺激性食物平时不要吸烟，不要喝酒，不要上火，饮食以清淡为主。
扁桃体结石可以对着镜子，把手电的光源照进嗓子里，张嘴发的声音，会看到两侧的扁桃体凹凸不平，在隐窝里头可以看见白色、质硬的物质，有的时候会有异味，引起口臭，所以严重的要处理掉。进食后要及时漱口，避免食物残渣存留于扁桃体表面，再次引起结石形成。
