阴茎短细，这应该是包皮过长造成的。包皮环切术可以用于治疗。阴茎第一次能长多长时间还不确定。如果它仍然太小，阴茎生长手术可以进行。在此期间，注意清淡饮食，不要吃辛辣刺激的食物。
很有可能是龟头炎。应当及时的清洗，保证局部的卫生，干净。在平时的时候应当服用一些消炎药物来进行治疗。观察一段时间，如果发现没有好转，这时应当及时去当地医院男科进行检查治疗。
阴茎出现疼痛的症状，很有可能是尿路感染或者是阴茎局部的皮肤感染。
患者可观察阴茎上是否有红点、瘙痒、肿胀等症状，考虑是阴茎感染炎症所导致，可以局部涂抹抗炎药物进行治疗，如果是尿路感染，一般是由于尿道口有细菌，且没注意清理，导致细菌扩散。建议患者前往医院进行尿检、血常规，以进一步确定病因，加以治疗。
建议患者平时多喝水，勤排尿，保持尿路干净，严重的情况需要根据医生指导口服或涂抹相应药物。
问题分析：目前因为有尿路感染，所以在排尿时会有疼痛的问题。
指导建议：可以吃一些消炎药物进行治疗，比如左氧氟沙星胶囊等。另外阴茎上不排除有疱疹感染的可能。明确为疱疹的话，需要用一些抗病毒的药物进行处理，比如阿昔洛韦乳膏。
可以带孩子看一下儿科或者小儿泌尿科，小孩现在还比较小，发育还不够完全，放松心态，注意观察，如果担心，可以前往当地医院完善激素六项和垂体功能检查。如果都是正常，可以继续等待。
不知道孩子的具体年龄所以不好确定，阴茎长度个体差异较大。任何年龄的小儿阴茎长度一般不少于1.42和直径不低于0.37，在某种意义上来说这两个数值是区别小儿阴茎长短和大小的参考值。
