小儿口腔疱疹发烧通常是受细菌和病毒感染引起的，建议进行针对性治疗。
小儿口腔疱疹发烧的原因可能是吃了过热过硬的食物，或清洁小儿口腔的时候用力过大，损伤了口腔内膜而发生的发炎、溃烂，会让小儿出现上呼吸道感染，导致发热，此时口腔容易受细菌和病毒感染，引起口腔疱疹。营养不良的小儿发病率较高，平时要多加注意。当体温达到38.5度时，可以进行温水擦拭来降温，或遵医嘱给小儿使用退热药物，无法控制的时候需要去医院及时就诊。
发烧好不好，这个问题要辩证来看。发烧是人体对感染的一种全身性防御反应，轻度或中度的发烧有利于增强机体防御系统的活性，提高人体的抗病能力，发烧时白细胞释放增多、吞噬细胞作用增强，有利于感染的控制。
一般情况下，小儿口腔疱疹可能发烧3-4天，具体分析如下：
儿童口腔疱疹主要是因为病毒性感染所致，出现发热3-4天，出现了急性高热和咽部疼痛症状，可以服用一些抗病毒的药物，例如用利巴韦林气雾剂在孩子的嘴巴上喷洒，可以服用儿童咽扁颗粒，如果温度高于38.5℃，可以服用一些布洛芬混悬滴剂，还可以通过物理疗法进行降温，例如用酒精、温湿的毛巾擦孩子的手掌，足底，腹股沟等静脉充盈的地方，促进其散热。
口腔溃疡是不会引起发热的，如果患者存在发热的情况，可以考虑为口腔溃疡并发细菌感染等。应尽早去专业的口腔医院黏膜科就诊，并且查一下血常规或者病毒感染等，检查一下是否存在细菌感染，确认一下是哪一种细菌过敏，然后对症用药，针对性用药。如果存在细菌感染的情况下，可以服用抗生素。
这有可能是疱疹性咽喉炎或者口腔炎，除此以外手足口病的可能性也有，可以就医检查手部口腔以及臀部的是否长有皮疹，排除手足口病后选择口服药物治疗，如果有出现口腔疼痛，还可能需要口腔喷雾剂以缓解症状。
考虑疱疹性咽峡炎由于病毒感染引起的，病程在一周到十天左右。需要在指导下口服药物，会反复发烧几天的，反复发烧是由于病原微生物没有完全消灭所致，这种继续配合治疗。
