黑色素痣通常可以通过冷冻疗法、切除手术等方法去除。
1.冷冻疗法：黑色素痣是由一群良性的黑色素细胞组成的，可见于身体各个部位，比如面部、手臂、背部等。若是没有恶变倾向，而且直径较小，一般无需进行特殊处理。若是没有恶变倾向但直径较大，影响了美观，则可以进行冷冻疗法，即指通过冷冻液态氮作用于组织表面，使痣细胞和色素细胞坏死，从而达到祛痣的目的。其费用与地区消费水平、黑色素痣的大小等息息相关，可能需要500-2000元。
2.切除手术：如果黑色素痣不断增大，而且颜色不断发生变化，说明黑色素痣可能存在恶变倾向，需要去医院进行病理检查。如果存在恶变倾向，建议通过切除手术去除病变部位，从而控制病情发展。
脸上长色素痣还是用激光的方法进行治疗比较好，而且激光治疗的效果会比较好，不会留下疤痕，但是要注意术后的护理，完全结痂之前要少接触水，平时也要注意避免日晒，通常只需要一周的时候就会自然脱落，效果还是很不错的。
脚上黑色素痣通常并不一定要切，具体情况可以根据局部黑色素痣生长情况来判断。
黑色素痣生长比较偏小和生长速度比较缓慢情况下，多数并不一定要切除，属于良性病变，可以继续观察，多数并不会导致自身健康造成危害。局部黑色素痣生长面积较大和生长速度比较快情况，多数一定要手术切除，有利于防止生长面积加重，同时可以降低恶变几率。
手术切除黑色素痣需要到正规医院选择专业医生，相对安全性较高，有利于降低风险程度和危害性。
对于一些面部影响美观的细小黑色素痣，可采用激光来治疗，激光去痣治疗方便，效果显著；皮肤色素痣多数是由于先天遗传因素，出生就有的，如果突然出现并且变大，生长较迅速，还应该考虑是否是黑色素瘤，如果是黑色素瘤的话，应该及时尽早去医院采取激光，加水进行治疗，或者是采取微创手术处理。单纯性的色素痣，一般激光治疗就可以。
如果色素比较浅，而且面积比较小，可以采用激光治疗的方法。激光治疗是先擦洗治疗部位，消毒，然后用激光作用于病变皮肤，传输的能量会在瞬间使组织里的水分气化，同时带走有色素的皮肤组织，而不伤及周围健康组织。但是如果面积较大的色素痣，而且颜色比较深的情况下，就需要采用植皮的治疗方法。
