一般治疗的时间和严重程度有关的，有的可能在一周到半个月左右的不等，需要定期到医院复查，平时一定要注意个人卫生避免感染，肛瘘的主要原因是肛周脓肿，直肠肛门损伤，肛门裂反复感染等因素导致的。
术后需要半月到一月时间恢复。平时一定要注意饮食生活作息，少吃辛辣刺激的食物，少喝酒，多注意局部的卫生清洗，勤换内裤。平时只要注意清淡饮食，保持大便通畅，便后注意切口清洁与消毒，定时回医院复诊，防止假性愈合。
肛瘘一般多为化脓性感染所致，少数为特异性感染，如结核、克罗恩病、溃疡性结肠炎等感染亦可所致。通常术后需要半月到一月时间恢复，手术观察期间要注意饮食生活作息，少吃辛辣刺激的食物，少喝酒，多注意局部的卫生清洗，勤换内裤。
肛瘘手术分为两种，一个为高位肛瘘的挂线疗法，还有一个就是低位肛瘘的直接切除治疗，两者在术后都需要进行温水坐浴，定期换药治疗，时间一般需要一个月左右，手术后不到三周即可痊愈了，痊愈后注意饮食，不要吃辛辣的食物，饮食多注意清淡点比较好的，多注意好休息。
肛瘘手术需要20分钟左右的时间。手术过程是，麻醉后，取截石位，常规消毒肛周皮肤、肛管和肠腔，铺无菌巾，以食指在肛门内引导，右手持探针从肛瘘外口探入，找到内口后探出。
轻微肛瘘3周左右会恢复。出现皮肤瘙痒时，避免用指甲抓挠，平时要保持大便通畅，养成定时排便习惯，保持肛周清洁卫生，勤沐浴、勤换内裤，每日睡前或便后温水坐浴。适当参加体育锻炼，如散步、打太极拳等，避免久坐、久站。
