碘酊具有强大的杀菌作用，一般取2%浓度用于注射部位皮肤消毒或早期疖肿的消炎，但有较强的刺激性、腐蚀性，所以用于皮肤消毒后应以70%酒精擦拭脱碘，且禁用于黏膜或伤口内消毒，否则会引起剧痛和红肿。因此碘酊脱碘的原因就是碘酊有较强的刺激性、腐蚀性，并且有些患者对碘过敏，用后及时脱碘可以防止碘造成过敏。
给宝宝脐带消毒时，较常用的是碘酒，碘酒的挥发性、刺激性小，每天消毒两次早晚各一次。也可以用碘伏先消毒，再用酒精脱碘。用酒精脱碘时用棉球在肚脐中心，以转圈的方式向外擦，能够起到脱碘、消毒的作用。
碘酒没有杀灭寄生虫的作用，不能治疗阴虱。
阴虱是一种寄生在人体毛发的寄生虫，主要是长在阴部以及肛周围。患者在使用药物的同时，需要先将阴毛剔除干净，然后再将内衣内裤和床上用品都用热水烫洗，且保持卫生清洁，用清水清洗生殖器，然后使用药物进行局部涂抹。
龟头炎可以使用碘伏外涂治疗，碘伏除杀菌作用，还有一定的抗真菌作用。杀灭能力相对较强，而且碘伏对皮肤黏膜刺激性相对较小，可以用于阴部皮肤外涂治疗。禁忌使用酒精制剂，如碘酒或医用酒精等治疗，因为碘酒及酒精内均含有刺激皮肤黏膜的酒精成分，可引起黏膜疼痛或红肿等现象。
儿童在打完卡介苗后会出现破溃，如果有脓水，可以用碘伏擦拭，只需将脓液擦拭干净即可，无需定期进行消毒。最好是用干棉棒清洁一下。儿童在接种了卡介苗后，会在接种处产生红肿，并形成肿块，随后肿块中心逐渐柔软，形成小水泡，再破裂，脓水溢出，形成溃疡，最终结痂，形成卡疤。如果有红肿、肿块、脓泡等情况，一般不需要用碘伏进行消毒、热敷、挤压等。
一般情况下，破皮了能用碘伏消毒，具体内容如下：
碘伏具有广谱杀菌的作用，能够有效的杀灭细菌、真菌、原虫等，还能杀灭部分病毒，是临床上广泛使用的杀菌消毒剂。因此，如果患者皮肤破了，可以用碘伏消毒。此外，用碘伏还有助于缓解皮肤组织的充血水肿、肿胀淤血、出血等症状，也有利于预防或治疗细菌引起的伤口感染化脓。
