自闭症可能是由生理因素形成，如神经机能发展，生化机能发展，遗传因素或脑部受损所致。妇女怀孕期间可能因德国麻疹或风疹，使胎儿的脑部发育受损而导致自闭症。新陈代谢疾病亦会造成脑细胞功能失调，影响脑神经传递信息的功能，因而造成自闭症。还有，在怀孕期间窘迫性流产等因素而造成婴儿大脑发育不全，早产，难产，新生儿脑部受伤，以及在婴儿期患上脑炎，脑膜炎等疾病造成脑部伤害，都可能会增加罹患自闭症的机会。
与神经系统的发育有关，比如进行功能性磁共振检查，可发现自闭症孩子的大脑某些功能区发育的不是很好，比如额区、颞区，或者杏仁核，海马回等大脑的边缘系统，即与人类情绪有关的区域发育有异常。与围产期的高危因素有关，比如在围产期，就是怀孕或出生的时候有感染，这些孩子发生自闭症的几率会增高。
孩子在生活中会沉默不语或较少使用语言，倾向于用手势或其他形式来表达他们的愿望和要求时，家长就应该小心了。很多孩子还会有兴趣范围狭窄以及刻板、僵硬的行为方式对环境，家长应该及时带着孩子到正规的医院进行诊断。
有自闭症可以心理治疗：心理辅导在自闭症的治疗中是极其重要的，要注意帮降低自卑和孤僻心理，增强本病的信心和愿望；严禁打骂患儿，避免责备埋怨，积极鼓励和谈心沟通是较有效的方法。药物治疗：西药虽然见效快，但副作用大，很容易使孩子导致营养不良而影响骨骼的发育，停药后可能导致复发，长期服，会使对药物产生依赖。而中药则见效慢，治疗周期长，并且药物口感不好会导致孩子难以配合治疗。
孤独症通常发生在儿童中，其诱发要素与通常遗传、分娩期、免疫、环境等要素有关，特别是与环境要素的影响以及儿童童年的成长经验有关。孩子引起自闭症，是因为小时候的不幸经验，或者受到了这种类型的伤害。教育和训练是治疗自闭症的方法，问题很严重，但是可以改善。
