大部分的医院会采用激光或者冷冻的方法来治疗跖疣。这种方法属于物理治疗，见效快，但是比较容易复发。用切除的或者腐蚀的方法对跖疣的角质皮层去除，属于物理治疗，容易复发。跖疣是由人体病毒感染引起的，不建议使用创伤性的治疗方法。
足底疣是由病毒感染引起的，摸起来很硬。如果你在用手按压或行走很长时间后感到疼痛，不要用手抠。平时你应该穿宽松的鞋子。也可以用激光手术来治疗它。平时不要站得太久，以免因压力过大而使病情加重。必须经常洗脚。洗脚时，患者可以在水中加盐来提高杀菌效果。
跖疣病毒感染，对于这个疾病的治疗目前的治疗方法有冷冻、激光和外用药物。冷冻需要连续多次，每两周一次。如果非常多，可以用水晶膏化学制剂来腐蚀局部皮肤，从而治疗。浅层X线放射治疗也有效，不要让跖疣破裂，破裂流出来的水碰到好的皮肤会传染的。
跖疣的治疗可以通过局部手术来完成，而对于较小的状态可以使用局部激光或微波来去除疣。经过激光或冷冻或微波治疗后，局部皮肤会出现坏死和感染的可能性。要及时用碘伏进行局部消毒，防止感染。
如果确诊是有跖疣，单纯外用药效果是极差的。因为只跖疣比较致密，药物很难完全渗入其中，因此单独外用很难治好。一般治疗是液氮冷冻疗法，它可以杀死病灶。如果去当地公立医院的皮肤科，亲自去看医生，患者可以做液氮冷冻治疗。
