指甲凹凸不平不排除是营养不良导致的，也可能是身体维生素缺乏A、钙质所致。平时要多吃些胡萝卜、动物内脏等来补充，还要多食用些优质蛋白质。如果还伴有指甲颜色异样，甲床变脆等症状，则也考虑是灰指甲的因素，需要去门诊做个真菌检查。
指甲盖上出现坑坑洼洼很可能是营养不良，或者是缺乏一些矿物质以及一些微量元素引起的。可以到医院去检查一下微量元素，平时要吃一些含维生素或者是含一些矿物质的食物。但是也有可能是真菌感染导致的，所以在平时一定要注意清洁。
手指甲盖凹凸不平常见由甲癣、缺乏维生素A等因素引起。
1、甲癣：手部卫生条件差就可能患有甲癣，该疾病容易导致病甲出现变形、浑浊、增厚、分离、变色等情况，所以可能表现为手指甲盖凹凸不平，可遵医嘱使用环吡酮胺乳膏、盐酸特比萘芬溶液等药物治疗。
2、缺乏维生素A：患者存在长期挑食的情况导致体内缺乏维生素A，便容易使得角质化减弱，导致指甲出现变软、变薄、易断裂、变形等症状，因此缺乏维生素A也可能造成手指甲盖凹凸不平，通常可适当多吃胡萝卜、菠菜、鸡蛋等富含维生素A的食物进行改善。
指甲出现坑坑洼洼的现象见于灰指甲，是由于指甲受到真菌侵犯之后引发的指甲破坏性疾病，表现为指甲表面出现浑浊、增厚、表面坑洼不平，同时容易变脆易折断的现象。灰指甲是由于身体其他部位的真菌逐渐感染而来。
手指上凹凸不平首先要除外局部磕着碰着引起的，然后再来根据身体是否有其他症状判断是否与某些疾病相关，如糖尿病、麻疹、肺炎、外周血管疾病、腮腺炎等，但也不能通过单一症状得出结论，建议进行相关检查再行确诊。
指甲上出现坑坑洼洼的小点，考虑甲凹点的可能性大，甲凹点有时与其他皮肤疾病有关，最常见的就是银屑病及斑秃，银屑病患者会出现顶针样甲，慢性湿疹以及甲营养不良也会导致甲凹点的发生。如果有上面疾病，需要积极治疗原发疾病，指甲也就会明显好转。
