宝宝在患上肛瘘以后，会因为肛门周围皮肤分泌物的刺激，出现瘙痒的症状，经常用手去抓挠肛门儿部位，这时检查一下宝宝的肛门周围，会发现宝宝肛门周围的皮肤变色，表皮有脱落。刚形成的肛瘘流脓比较多。味道很臭，颜色发黄，慢慢的逐渐减少，时有时无，呈白色。由于瘘管不受控制，还会一个劲的放屁。
可以观察脓液的多少，脓液减少，周围红肿减少，说明肛瘘在渐渐变好。多注意宝宝肛门出的干燥，清爽。尽量少的接触不干净的东西。少吃油腻饮食，应多吃清淡含丰富维生素的食物，如绿豆，萝卜，冬瓜等新鲜蔬菜。
低位肛瘘与高位肛瘘症状是一样的，主要表现是肛门流脓、肿痛、肿块、瘙痒等症状，脓液经常刺激瘘口周围皮肤，致肛门皮肤瘙痒或湿疹。确诊是需要行肛门指诊或直肠镜检查，治疗是需要手术治疗的。
流脓是肛瘘的主要症状，脓液多少与瘘管长短和多少有关；疼痛，瘘管通畅无炎症时常不感疼痛，只感觉局部发胀和不适，行走时加重，当瘘管感染或脓液排出不畅而肿胀发炎时，可引起疼痛；瘙痒，脓液不断刺激肛周皮肤引起；急性炎症期和复杂性肛瘘反复发作时，可出现不同程度的发热、或伴有消瘦、贫血、体虚等长期慢性消耗症状。
肛瘘癌变症状大多表现为大便性状的改变和大便出血。肛瘘是直肠粘膜与肛门周围皮肤之间形成的异常通道，如果肛瘘癌变，就应该及时到正规医院检查，查清病因，可以采取手术的方法进行治疗。
瘘外口流出少量脓性，血性，粘液性分泌物为主要症状，较大的高位肛瘘，因瘘管位于括约肌外，不受括约肌控制，常有粪便及气体排出。由于分泌物的刺激，使肛门部潮湿，瘙痒，有时形成湿疹。
