治疗龟头炎的方法是要针对发炎的原因，因此会因人而异。医生会因病情、其对生活的影响及身体是否有其它疾病，而建议最恰当的治疗方法。口服或外用的抗生素，主要用于治疗由细菌或霉菌感染引起的龟头炎。若龟头炎是由于皮肤受化学物品刺激而引起，就要避免再接触有关的化学物品。
龟头流脓尿道疼痛是尿道炎的表现，一般见于急性淋病，是由淋球菌感染引起的性传播疾病。口服药物后效果不明显，仍然有绿色的脓液。尽快到医院检查确诊进行系统治疗，避免逆行感染。同时做好隔离，暂停性生活，避免到公共游泳池和浴池，以免传染他人。
龟头流脓尿血考虑是淋病，与性爱生活或是尿道口污染后感染。及时到医院化验尿道口分泌物，做细菌和病原体培养检查加药敏试验，根据药敏结果选择敏感的抗生素坚持治疗2周，两种后再次做培养复查，阴性可以不用药物。
脓尿是乳白色的。严重时可以有脓块，一般常见于尿路感染。如果离心尿液中白细胞数大于等于每高倍镜下视野10个，就可以诊断为脓尿。脓尿的诊断标准即尿沉渣检查时每个高倍镜视野白细胞和脓细胞数均大于5个。
就列出来的症状来看，很可能是被传染上淋病了，建议到泌尿外科开单取尿道口分泌物化验，若发现有淋球菌即可确诊，确诊后如对青霉素不过敏，可以输青霉素一周即可好转；对青霉素过敏者可以换用壮观霉素或淋必菌治疗，暂不宜同房，戒烟酒，少食辛辣油腻油炸食物，多喝温开水。
阴茎流脓尿痛可能是淋病或非淋病尿道炎的疾病。需要及时的去医院检查，对症治疗。这期间要注意饮食清淡，多喝水，多吃新鲜的蔬菜和水果。还要适当的锻炼身体，提高自身的免疫力。
