唇腭裂的治疗主要是通过整形来恢复口腔内的结构以及面部的畸形。但是选择什么样的手术方式以及手术时间还需要根据唇腭裂的轻重程度来考虑。最终的治疗目的是改善腭裂，恢复软腭的生理功能。术后还需要进行语言的训练来形成正确的发音。长大一些还需要到口腔科进行牙齿的矫正治疗。
二度腭裂挺严重的，二度腭裂即表现为软腭硬腭均有裂隙，但切牙槽完整。如果不加处理，不仅会影响婴儿时期的吮吸功能进而影响营养摄入，而且长期发展会导致面部塌陷，对孩子的身心健康都会有影响。
家长要保证患儿的营养和正常发育，避免呼吸道感染，以使患儿在全身健康状态下接受手术。若新生儿的裂隙很宽，或双侧唇裂者前颌高耸，家长需要尽早与医院联系，医生可根据情况给予必要的指导，或提前采取一定的措施以利于手术的进行。
主要病因有：母亲怀孕早期感染流感病毒、风疹病毒；遗传因素；怀孕期间服用镇静药、抗癫痫药、激素类药或大量接受X线照射等。主要表现为出生后上唇和上颚裂开成两瓣或三瓣，唇裂手术时间为生后3个月。腭裂为生后18个月。
唇腭裂是母亲在生长发育过程中一些不利因素造成的。这些因素可归纳为遗传因素和环境因素两大类，临床实践中经常发现唇腭裂患儿，在其直系或旁系亲属中，也有类似的畸形，这是由于某个基因的突变造成的。环境因素指的是胚胎生长发育的环境。母体是胚胎生长发育的温床，如果母体受到外界的干扰，就会影响胚胎发育。
