治疗复发性口腔溃疡采取全方位数字自动分析仪，口腔，细菌培养，免疫检查这些来明确病因，针对性的治疗的，主要是因为免疫失衡引起的，要从中医角度去提升自身免疫力，先要找准病因，然后再针对性对因施治。
复发性口腔溃疡可能跟营养不良、维生素缺乏、微量元素缺乏，如缺铁、叶酸、B12以及锌等有关的，平时要注意多吃蔬菜水果，可以口服葡萄糖酸锌和维生素B2，应注意保暖，防止感冒，饮食清淡忌辛辣。
口腔溃疡反复发作会癌变的，口腔溃疡有良性与恶性的区别，其中恶性口腔溃疡会是癌变，这二者之间有明显区别。可以多吃新鲜蔬菜水果补充维生素，即可减少口腔溃疡。
儿童口腔溃疡的复发时间与儿童的口腔溃疡病史有很大的关系。病史短则数月，多则一年，也有可能是儿童口腔溃疡新旧交替。
因为儿童口腔粘膜较薄，容易被热的食物灼伤，或者是吃东西时咬伤，进而发生感染导致小儿口腔溃疡。儿童出现口腔溃疡是由于儿童出现腹泻、营养不良等原因造成的，中医认为儿童属于纯阳之体，自身条件还不健全，饮食习惯、穿衣等方面稍有不规律，就会导致口腔溃疡。
以消除病因、增强体质、对症治疗为主。治疗方法应该坚持全身治疗和局部治疗相结合，中西医治疗相结合，生理和心理治疗相结合，对症治疗。口服维生素B、C和增进机体的抵抗力，有助于溃疡的愈合。
