新生儿接种乙肝疫苗需要在第一天接种第一针，第二针在30天内打第二针，180天打第三针。
现在普遍认为三次乙肝疫苗能够促进人体的免疫，从而降低乙肝病毒的感染几率，降低母亲的垂直传播的危险。不过，接种了乙型肝炎疫苗并不意味着就能得到保护的抗体，而保护性抗体的生成与自身的免疫力有关，因此需要在一周岁左右做一次血液检测，检测到乙肝两对半，以确定是否得到了保护的抗体，如果乙肝表面抗体为阴性则需要进一步接种。
卡介苗和乙肝疫苗可以一起打。
卡介苗是由减毒牛型结核杆菌悬浮液制成的活菌苗。卡介苗可与乙肝疫苗同时接种，不影响彼此效果，并能改善乙肝表面抗原阳性，但应分别向左，右两侧臂进行接种。接种24小时之内切忌沐浴，注意观察皮肤的表面状况及接种后的进食和排便情况、睡着了等，如果不舒服，要与接种机构取得联系，及时咨询医生。
一般情况下，新生儿黄疸通常不能打乙肝疫苗。具体分析如下：
新生儿在出生后的第一个月和六个月内打乙肝疫苗。如果新生儿满月30天，预防接种时会帮新生儿进行黄疸的检测。如果肉眼可见发黄，就不能打乙肝疫苗，需要查明病因。如果出现了轻微的黄疸，需要去医院做检查。新生儿需要在黄疸消失后，肝脏功能恢复，没有其他病理性的黄疸时，方可打乙肝疫苗。
乙肝疫苗和卡介苗能分开打，不在同一个胳膊。一定要分开手臂进行接种，通常是乙肝疫苗接种在右手，另一个接种左手，如果由于某些原因没能接种，乙肝疫苗接种在先，那就2周后再接种；如果后一个接种在先，那要1个月后再接种乙肝疫苗。
乙肝疫苗第2针一般在满月后接种，但是如果孩子有异常情况，比如发热，黄疸，流涕，咳嗽，腹泻等症状时，是不能接种疫苗的，因为会使病情加重，对孩子的身体健康造成损害，此时应该延期，积极治疗疾病，直到病情完全恢复时进行接种。
