使用生长激素会导致一定的副作用，比如过量使用生长激素可能会使儿童患上巨人症，可能会出现头痛、恶心、呕吐、降低儿童的骨密度。甚至导致其他激素的功能紊乱，比如会出现甲状腺功能减退症等。
发育期如果生长激素过量的时候，可以导致巨人症，骨质疏松等危害。长骨骨骺闭合以后，如果另外注射生长素，除了没有增高效果外，还会有效肢端肥大症，影响到美观。不过生长激素分泌不足，则会导致侏儒症。使用生长激素前，应该先做垂体功能检查，确定有生长激素不足，再考虑注射。长骨骨骺闭合以后，多不宜再注射这种药物。
儿童个子矮打生长激素有没有副作用，需要根据实际情况来判断，具体分析如下：
1.有副作用：如果儿童体质较好，且打生长激素的量比较少，这种情况下，一般不会有副作用。
2.没有副作用：如果儿童体质较差，且打生长激素的量比较多，这种情况下，一般有副作用，如关节疼痛、头痛、关节炎、关节病、肌肉疼痛等，甚至出现感觉异常、感觉减退等不适症状。
打生长激素的副作用有，注射部位发红、皮下脂肪萎缩，肝功能转氨酶升高，恶心呕吐、腹痛等不适，50%以上病人会出现抗体，但不影响治疗效果。生长激素还可能引起一过性高血压现象，随着用药时间延长或停药后血糖恢复正常。
比如有的对激素过敏，如果过量食用，很有可能会造成巨人症，第二性征发育不健全。如果是有高血压的儿童注射后，可能会出现颅内高压；如果长期缺钙，有可能造成骨骺滑出或坏死。
