主要是由于留取尿液时出现错误造成的，正常情况应该是留取中段尿液，这样的尿液比较纯净，鳞状上皮细胞数量很少。但是在刚一排尿就接取尿液时，这种标本中就会混有大量鳞状上皮细胞，因为女性的尿道开口周围有大量鳞状上皮碎屑，就会随着尿液留取到尿常规标本中，这也是临床上鉴别留取的标本是否合格的一种有效方式。
上皮细胞高是泌尿系统尿路上皮细胞脱落掉落在尿液中，是正常的新陈代谢过程，尿液由肾脏肾小球过滤分泌到肾盂里，通过输尿管的蠕动进入膀胱。在膀胱内尿液达到300ml左右的时候，由尿道排出尿液。
通常提示尿液标本的污染，如包皮垢或者白带的污染。如果尿常规中非鳞状上皮细胞增多，同时尿中白细胞增高、亚硝酸盐阳性、尿中细菌成分增多，通常存在有泌尿系统的感染。
尿常规检查中上皮细胞数目增高，可能是泌尿系统感染时，泌尿系统上皮脱落增加，这时尿检可见上皮细胞数目增高，或是泌尿系统存在有结石，也可以引起局部黏膜脱落、上皮细胞高。
尿液中所见上皮细胞由肾小管、肾盂、输尿管、膀胱、尿道等处脱落混入而产生。尿常规检查细胞包括红细胞、白细胞、上皮细胞，正常人尿液中可发现少量上皮细胞。肾小球肾炎、肾小管病变时，可出现较多上皮细胞。阴道分泌物混入尿液中也可使上皮细胞增多。
一般情况下，孕妇尿常规小圆上皮细胞偏高可能是分泌物混入造成的，具体内容如下：
尿液中的上皮细胞主要来源于膀胱、输尿管、尿路等部位，如果孕妇的外阴的局部有大量的分泌物，可能会在检查时有分泌物混入，从而影响检查的准确度，出现尿常规小圆上皮细胞偏高的情况。孕妇应注意在保留尿液时要注意清洁外阴，并取间断尿。此外，尿常规检查结果中有少量的上皮细胞也是正常的，孕妇无需过度紧张。
