严重的口腔溃疡治疗，需要全身加局部治疗相结合，局部治疗可以使用一些止疼类药膏，也可以使用促进局部愈合型药物，全身用药主要是使用增强免疫力类药物，如果溃疡继发感染，可以使用抗生素类药物进行治疗。
发作频率有一定规律性，每月一次以上属于频密，一般2个月或3个月发作一次，存在季节性的发作高峰期。口腔溃疡可以自愈，一般发病到痊愈的周期在7~15天之间。好了之后基本没什么后遗症。它是否会转化为“扁平苔癣”（属于组织细胞变异）尚不好说。
口腔溃疡的临床症状就是溃疡表面凹陷，呈圆形，表面有白色或者是黄色的假膜覆盖，溃疡周围有红色的充血带，病人常常有强烈的疼痛感，特别是进食辛辣食物时疼痛感加重。口腔溃疡一般都有自限性，一般在一周到两周内，溃疡可自限性愈合。
癌变的口腔溃疡会有淋巴结肿大、淋巴结粘连的表现，口腔黏膜会有异常的白斑、红斑、红白斑或是褐色的斑块症状出现。如果口腔溃疡癌变，癌细胞可能侵袭了张闭口肌或者下颌关节，开闭口运动就会受到限制，甚至出现疼痛感。而且颚骨与牙龈会出现局部性肿大现象，有时合并有牙齿动摇现象。
预防口腔溃疡的主要的方法是科学的因素和多吃蔬果等，适当的补充维生素，才能避免复发的，平时少吃上火的东西，建议平时避免粗糙过烫食物对黏膜的刺激，营养均衡，饮食清淡，保持有规律的进餐习惯。
