核磁共振是股骨头坏死早期最敏感最有效的诊断方法。可以鉴别股骨头坏死范围和程度，可以发现不同程度的骨髓水肿及关节内积液，在t1和t2像上可以看到股骨头局限坏死区和正常骨质之间，可见线样低信号改变，这就常说的线样征，核磁检查是早期诊断股骨头坏死最具特异性最灵敏的检查方法。
核磁共振是股骨头坏死早期最敏感最有效的诊断方法。可以鉴别股骨头坏死范围和程度，可以发现不同程度的骨髓水肿及关节内积液，在t1和t2像上可以看到股骨头局限坏死区和正常骨质之间，可见线样低信号改变，这就常说的线样征，核磁检查是早期诊断股骨头坏死最具特异性最灵敏的检查方法。
核磁共振脑萎缩可以诊断的。是在影像上脑萎缩主要表现为脑沟、裂、池的增宽，加深。鉴别诊断包括有老年痴呆，脑瘫，中枢神经系统的变性代谢类疾病，炎症等，也可以引起脑萎缩的改变，所以重要的就是要确定脑萎缩的具体病因，然后积极的针对病因进行治疗。
怀孕期间可以进行核磁共振检查，因为孕妇有肥胖、羊水不足、胎儿已经进入盆内，或者是产前超声无法确认的情况。
可以为胎儿胃肠道和消化道的异常情况提供更多的补充资料。建议孕妇和家人不要害怕核磁共振会产生辐射，也不要担心会对胎儿的发育有什么影响。在怀孕的3个月内，胎儿正处在细胞的分化发育阶段，因此要避免做核磁共振。
孕期尽量不接受核磁共振检查。如需明确诊断，亦可进行核磁共振检查，但在妊娠早期，即妊娠头3个月内，尽可能不进行核磁共振检查。
由于在怀孕早期，胎儿各脏器都处于发育成熟阶段，是致胎畸形敏感期，妊娠中晚期可进行核磁共振检查。如妊娠中晚期，胎儿侧脑室宽大，一般不超过1.0厘米，如果超过1.5厘米的话，彩超即可确诊为脑积水；
若侧脑室宽度为1.0~1.5厘米，则需核磁共振来明确胎儿畸形及去留。
一般情况下，核磁共振是神经外科最常用的技术之一，应用于大脑病变患者，甚至是癫痫症患者。MRI可以检测到脑部的组织是否有任何的问题，比如肿瘤、出血、创伤、脑组织的畸形等。而且，清晰度更高，甚至可以通过谐波检测，观察到微小的损伤。CT会产生一些放射性物质，对于一些孕妇和即将受孕的女性来说，最好不要接触。而核磁共振成像则比较无放射性，因而更为保险。
