首先要检查患者是否有消化系统的疾病，比如胃食管的反流、慢性胃炎等情况，首先要排除这方面的情况，然后再来考虑是否咽喉部的慢性咽炎等情况。慢性咽炎因为咽部的敏感性的增高，它可以导致在刷牙时出现恶心、干呕。
在刷牙的时候有出血以及疼痛的症状，也是考虑由于体内维生素的缺乏引起的症状，去医院做个血常规的检查，依据检查的结果做对症治疗，平时的时候注意口腔清洁卫生，治疗期间补充些维生素丰富的食物。
对引起口臭的病因进行治疗，才能真正做到治好解决口臭，只是对症处理基本上都不能获得满意效果。口臭原因很多，龋齿、牙周病最常见，萎缩性鼻炎、化脓性气管炎、肺脓肿等感染性疾病也会造成。
可以喝清热去火类的茶。口臭有可能是牙周病引起的，也有可能是牙周卫生不佳，牙石软垢堆积也会引起牙龈炎症出现口臭。但是也不排除是口腔内有龋齿或者是胃肠不适也可能引起口臭。
牙龈萎缩是因牙周疾病所引起，在牙龈底部有牙结石，牙结石可以造成牙龈萎缩、牙根暴露松动脱落等。牙龈萎缩分为病理性萎缩和生理性萎缩两类，随着年龄的增长会发生或多或少的牙龈这群，使牙根暴露，这种叫生理性萎缩，生理性牙龈萎缩是不需要治疗的。但可以通过保健延缓。对于病理性牙龈萎缩则要定期进行洁治，洁治是预防牙龈炎的最有效手段。
起床刷牙恶心干呕可能是妊娠、胃肠功能紊乱等原因导致的。
如果近期有过无保护性行为，可能会导致妊娠，从而导致起床刷牙恶心干呕，这种情况比较正常，通常不需要进行特殊的治疗。
胃肠功能紊乱是由生物、心理、社会、疾病等因素引起的胃肠异常情况，可表现为反酸、嗳气、恶心、呕吐等。也可能会导致起床刷牙恶心干呕，建议在医生的指导下使用药物进行治疗，常用的药物主要有多潘立酮胶囊、枸橼酸莫沙必利片等。
