隐球菌性脑膜炎要治愈，属较难，可出现不同程度后遗症，建议病人能及时就医处理，以免病情恶化。
对于早期阶段的隐球菌性脑病患者，可以使用抗生素来进行预防和治疗，但是如果在后期出现了感染症状，则需要采取手术或者其方法进行治疗，以防止进一步发展成为严重并发症而导致死亡。隐球菌性脑膜炎治疗原则是早期发现，早期处理，但是，由于新型隐球菌属于真菌，仅有少数抗真菌药物对其有治疗效果，因此，治疗时间将相对延长，还容易重复。
真菌性脑膜炎的治疗的确是比较复杂，由于真菌一穿过血脑屏障，处理较为困难。临床上对于此类疾病可以采用药物进行干预和预防，但是也不能忽视了对其预后的判断，尤其是早期诊断以及时治疗至关重要。病人表现为精神症状体征，可在脑实质内出现累及，后期极有可能使大脑发生不可逆损伤，因此，一旦发生不可逆损害，应不可能在痊愈，仅能控制或推迟病症的恶化。
真菌性脑膜炎是由于真菌侵入脑膜而导致的神经系统发炎，是一种深层次的真菌感染。早期不规则低热，体温一般在37.5-38℃，伴有头痛、呕吐、脑膜刺激征，可累及外展神经，儿童多为双眼不能外展，呈内聚状态。
治疗上采用分期治疗、联合用药、多途径治疗，治疗难度大，但也有一定的希望。病情较轻的病人或小孩可以在不需要任何治疗的情况下自行痊愈。
真菌脑膜炎可能传染。人类的真菌主要有四种。主要是一种表面的浅层霉菌，另一种是我们内脏的深层或全身性的霉菌，也就是机会性霉菌和亚急性的霉菌。
后三种真菌都是由真菌引起的，这意味着有一种血源性的感染，这种病毒会通过血型扩散到中枢神经，从而导致脑膜和大脑的炎症、脓肿和肉芽肿。一般来说，霉菌性的脑膜炎，是很难通过呼吸道传染的，如果病人的血液中有真菌，那么就会进入到人体的血液中，而这种细菌会通过血液系统的方式，很有可能会传染。
隐球菌脑膜炎的机率为56.6%～81%，但停药后有1/3病例可能复发，需要进行维持治疗。对于出现的颅内高压症状，必须及时处理，否则可能发生脑疝引起死亡。对于意识清楚的应鼓励进食高蛋白高营养食物，增强抵抗力，同时可输入新鲜人血浆或全血，补充各种维生素。
真菌性脑膜炎能够治愈。
真菌性脑膜炎是一种真菌性的感染，在自然界中是很常见的。不过，真菌感染在中枢神经系统的发病率要低很多，它的临床症状类似于结核性脑膜炎，这种病很隐蔽，进展很慢，有些人甚至会变成急性，病情会更严重。真菌性脑膜炎可以通过抗真菌药物和对症的全身支持治疗来改善。有些人可能需要12个星期以上，甚至6个月。