先天性甲状腺功能减退症的病因通常是甲状腺不发育、甲状腺激素合成紊乱、促甲状腺激素不足等。
1、甲状腺不发育：如果甲状腺存在发育不全或移位的情况，可能导致先天性的甲状腺功能低下，其中1/3是甲状腺完全缺如，剩余部分则是由于发育不全或在移位时在异常位置滞留，或者完全失去了功能。
2、甲状腺激素合成紊乱：在甲状腺激素的合成和分泌中，由于体内的酶存在缺陷，可能导致甲状腺素缺乏，进而诱发先天性甲状腺功能减退症。
3、促甲状腺激素不足：由于垂体分泌促甲状腺激素紊乱，可能导致促甲状腺激素不足，引起先天性甲状腺功能减退症，考虑与特发性垂体功能低下、下丘脑垂体发育不良有关。
甲状腺功能减退会导致肥胖。甲状腺功能减退是由于甲状腺素分泌减少而引起的疾病，临床上表现为乏力，粘液性水肿等症状，肥胖一般就是粘液水肿的问题，减肥需要保持甲状腺功能的正常，并且控制饮食，不要暴饮暴食，也可适当的运动进行减肥。
继发性甲状腺功能减退症临床表现是甲减的表现，但是它的原因和原发性的甲减不一样。甲状腺功能减退是由甲状腺激素合成和分泌减少引起的。原发性甲减、继发性甲减和周围性甲减是甲状腺功能减退的主要类型。下丘脑和垂体病变会导致继发性甲状腺功能减退。甲状腺功能减退可见于垂体肿瘤、脑卒中、脑垂体手术等。需要到医院做进一步的检查，明确病因，然后在医生的指导下进行治疗。
继发甲状腺功能减退主要是甲状腺上游器官垂体或下丘脑病变导致甲状腺激素分泌水平下降导致甲状腺功能减退。常见原因如下：
1、首先是垂体瘤、下丘脑肿瘤等肿瘤引起的。
2、应该有外伤和手术损伤导致的垂体和下丘脑损伤等损伤。女性常见疾病，称为席汉综合征，主要是产后大出血引起的下丘脑病变，可导致多种因素分泌减少，包括继发甲状腺功能减退。
百令胶囊主要的功效是补肺肾，益精气。主要是适用于肺肾两虚引起的咳嗽、气喘、咳血、腰背酸痛，慢性支气管炎的辅助治疗的，用于治疗肾脏疾病，治疗二型糖尿病伴蛋白尿，治疗反复发作性尿路感染甲状腺功能减退主要是补充甲状腺素治疗，肺肾亏虚的症状可以使用，甲状腺功能减退服用百令胶囊是不会有效果的。
目前不能治好，是由于甲状腺激素缺乏或不足或对其不反应致机体代谢活动下降而引起的一种内分泌病。应选择药物治疗，在药物治疗期间，按时服药，不要擅自停药或修改药量，定时复诊，根据复诊结果来调整药量，以便更好的治疗甲减疾病，平时注意营养丰富，补充足够的蛋白质，并限制脂肪、胆固醇摄入，应进食高热量、容易消化的食物。
