该病尚无特效治疗方法。治疗的目的是降低血小板的数量，血栓和出血的预后，并减少疾病的进展。血小板增多症分为原发性和继发性。血小板增多症是由于感染了自身免疫病导致，需要针对病因治疗。也有可能是基因突变导致。建议患者在血液科医生指导下进行治疗。
其治疗首先是药物治疗，包括骨髓抑制性的药物，还有抗血小板聚集的药物，可防止血小板太多而发生聚集。还有就是手术治疗，可以通过仪器把人体内过多的血小板采集到体外，即排出体外，以降低血小板含量。最近新兴的靶向药物，也逐渐用于到临床中。
原发性血小板增多症的治疗只要有两种手段。主要是通过羟基脲来抑制造血板的生成；也可以采取干扰素治疗，但治疗周期较长。此外，血小板若伴随骨髓纤维化也可以通过靶向药物治疗。
给予抗凝药对症治疗，血小板计数升高可能由细胞因子驱动机制引起，或者有不依赖生长因子的克隆性/肿瘤性巨核细胞过度生成引起血小板增多，如骨髓增殖性肿瘤或慢性粒细胞白血病等。
脾脏肿大引起血小板减低，是因脾功能亢进，从而导致的正常的血小板也被脾脏破坏引起的结果。出现种情况的首先，主要明确脾大的原因，如果是肝硬化导致的脾大的，需要给予肝脏功能的治疗恢复肝细胞治疗，解决肝硬化。如果是自身免疫性疾病导致的脾大，需要给予大剂量的激素的冲击疗法。
可服用抗凝药物以减少血小板聚集，以免形成血栓，也可服用抑制血小板过度生长的药物进行治疗，骨髓中可能有基因发生改变导致血小板增多，也可通过服用干扰素等药物减少过多的血小板生成，也可通过血小板单采术使血液中过多的血小板排出体外，进而达到治疗目的。
