操作得当不会有明显的疼痛。肛门直肠指检可分为肛外指检和肛内指检两部分。肛门直肠指检即肛内指检是在戴好手套或指套后，在食指和肛门部位涂些润滑油，将食指伸进直肠内的检查。
直肠指检主要观察肛门括约肌的情况，肛管直肠有无触痛，搏动，肿块狭窄及凹陷等。孕妇是可以进行肛门指检的，不会对孕妇和胎儿造成任何影响的。但动作一定要轻柔，避免刺激宫缩。
直肠指诊一般费用在五元-10元左右，这其中包括应用手套的费用。通过直肠指诊可以明确肛周是否有瘘管，赘生物，肛周包块。肛门括约肌松紧程度，是否有直肠内脱垂，直肠前突以及痔疮内痔的严重程度，直肠腺瘤或肿瘤。
通过直肠指检是能够发现比较明显的直肠癌肿块儿的。是否侵犯直肠外边或侵及其器官要进行CT检查。直肠镜镜检查可以直观并能够咬检肿瘤细胞区分良恶性。确诊需要肠镜检查病理明确诊断。
可以查出来的，肛门镜检查是肛门直肠疾病的常规检查方法之一，适用于肛管、直肠末端及齿状线附近的病变，还可进行活体组织检查。肛门镜可以直观的观察直肠粘膜，肠腔及肛管情况，因此可以检查直肠炎，直肠息肉，直肠癌，混合痔，肛乳头瘤，肛裂等肛门直肠疾病。
相对来说有点严重，直肠黏膜内脱垂，是直肠黏膜没有脱出在肛门外边，脱垂在直肠内部，是因为直肠黏膜松弛或者与盆底肌松弛造成的。主要发病一些年老的女性比较多。