亚急性甲状腺炎如果症状轻只需口服药物治疗即可，如果症状重颈部疼痛发热明显，就需要激素治疗，一般需要2周以上可以考虑减药。减药应慢，减药快易复发，需要在医生指导下根据辅助检查用药。
亚急性甲状腺炎有多种治疗措施，临床治疗通常是使用抗炎药、退烧药，若发热持续不退则需要使用糖皮质激素进行治疗，但在进行激素治疗前应评价患者是否适合激素治疗。具体治疗措施应由医生面诊后，根据患者情况给出详细的治疗方案。
如果是亚急性甲状腺炎，严重疼痛时可以使用非甾体类消炎药来止痛，亚急性甲状腺炎患者服用非甾体消炎药，并不一定能立即缓解疼痛。
部分患者服用非甾体类消炎药后，可能会出现颈部疼痛加重的情况。这时候可以适当使用激素类药物，使用激素类药物治疗后，患者的疼痛症状能够得到有效的控制，同时还可以控制发热，血沉增快的情况，但是需要逐渐减少用量，避免产生依赖性。
亚急性甲状腺炎以消炎止痛为目的，常使用非甾体消炎止痛药。若应用这类药物止痛无效，可在短时间内应用激素镇痛。
少数亚甲炎患者可伴有严重高代谢症状、心悸、怕热等，其表现非常明显，对这部分病人可在短期内应用β-受体阻断药控制上述高代谢症状。有些亚甲炎病人可并发甲减严重，病人可出现畏寒、乏力等变化，对这部分病人可短期用小剂量左甲状腺素钠片代替治疗，但不必长期服药。
亚急性甲状腺炎预后良好，病人不必有过多心理负担。
亚急性湿疹可以外抹一些止痒的药物，清热除湿、祛风止痒，用于急性亚急性湿疹证属湿热或湿阻型的辅助治疗。如果症状没有缓解的情况下，应该去医院就诊。注意用药期间，忌烟，忌酒，及生冷食物，宜清淡。
一般情况下，亚急性心内膜炎可以采用以下方式进行治疗：
亚急性感染性心内膜炎常在风湿性心脏病及先天性心脏病的基础上发生。患有亚急性心内膜炎，患者可以在医生指导下使用氟康唑、酮康唑等药物进行治疗。病情比较严重的时候，患者还可以采用外科手术的方式进行治疗。平时注意休息，不要过度劳累，不要食用辛辣刺激的食物。
