如果没有明显症状，囊肿可以完全不治疗。心包憩室也是由先天性发育不良引起的。如果没有症状，也可以不治疗。因此，对于这两种疾病，如果没有呼吸困难或心跳缓慢和加速等，可以考虑保守治疗。如果有明显症状，适当口服一些药物，看看是否可以改善。
心包囊肿可以手术治疗，术后一般愈合好，很少复发的，症状明显的改善或者是消失，如果不及时手术，有可能会引起心慌气短和咳嗽，心前区不适的。囊液流出至乳房腔，产生乳房水，更是会引发肺不张、乳房膜腔粘连等疾患，从而引发一系列重症问题。
心包囊肿也有一部分有胸部不适症状，如胸痛，胸闷或胸部胀满。如病变较大压迫心脏，可出现心悸，气短或心衰表现，有的人可因劳累或体位改变而症状加重。如果没有症状可以不做处理，出现症状了尽快到医院检查。
心包囊肿是一种少见的纵隔先天性囊肿。多位于右侧心膈角，少数位于左侧心旁。囊壁薄而透明，囊内含清澈透明液体，大部分囊壁与心包腔不相通。多数患者无自觉症状，偶然发现有症状者为心悸、气促、咳嗽及心前区不适等。
心包囊肿大多数病人无自觉症状，为其他各种原因的查体偶然发现，仅少数病人有胸部不适症状，如胸痛，胸闷或胸部胀满。心包囊肿是指发生于心包的一种先天性纵隔囊肿亦称为间皮囊肿、心包旁囊肿、胸膜心包囊肿纵隔水囊肿或纵隔单纯性囊肿等。
心包囊肿的治疗方法有胸腔镜下手术和开胸切除两种切除手术。心包囊肿是在胚胎时期就形成的，原始腔隙未能和其他腔隙隔合成心包，而单独形成一个空腔，在以后可发展成为心包囊肿。心包囊肿一旦确诊，一定要及时手术治疗。