新生儿巨结肠的治疗方法，通常有保守治疗与手术治疗两种。手术治疗在出生后半岁左右做最合适。但是如果巨结肠症状较严重，影响宝宝生长发育，保守治疗效果差，则需要尽早行手术治疗。保守治疗主要是指通过加强护理，定期温盐水清洁灌肠，促进宝宝排便来达到治疗目的。
新生儿巨结肠严重。新生儿是由于直肠或结肠远端的肠管持续痉挛，粪便淤滞的近端结肠，巨结肠肥厚、扩张，是小儿常见肠道畸形，巨结肠会导致宝宝无法排便！对于宝宝的身体生长发育会有很大影响，重症者可导致肠炎，危及生命。
新生儿巨结肠会引起顽固性的便秘。因巨结肠是由于肠道神经的缺如，从而引起肠道不能有效的感受粪团的刺激。大便中粪团非常多，就会出现明显的腹胀，也会出现剧烈的哭闹等症状，严重时会呕吐。
新生儿巨结肠最初的症状主要是胎粪排出延迟，逐渐进食以后出现腹胀、呕吐，肛门不排大便，肚子又鼓，听诊肠鸣音也会增强，正常肠鸣音2-4次，它每分钟可以7-8次，十几次都有，巨结肠的改变主要是腹胀，跟其他腹胀不一样，是慢性腹胀，腹胀比较厉害，像青蛙肚子一样，鼓鼓的，像非洲血吸虫病一样，肚子鼓鼓的，人不胖，肚子大，是均匀的肿大，从下面到上面已经都大、鼓了，而且没有大便。
NANB是中国20个神经行为测试的得分、检查方法和评定标准。
该指标主要用于新生儿神经发育状况的评定，共40分，分为5个部分，分别是对外界和外部环境的适应性。被动和主动肌肉的紧张，最初的反射状态和总体的反应。这是一个针对足月儿的评分，如果是早产儿，一般要进行40周的纠正。新生儿一星期超过37分是正常的。37分以下的婴儿，特别是在2个星期之内，37分以内的婴儿，要进行长期的跟踪。低于35分的患者，有一半的患者的预后较差。
新生儿黄疸抽血检查，具体分析如下：
新生儿黄疸从头部就是黄色的，而眼睛是最早黄色，可以先从眼睛观察，不用太紧张,都是两周左右就会自然消退。溶血性黄疸需要抽取母亲和孩子的血，检查是否有溶血，是否存在溶血，以及血常规、肝功能、尿常规、大便常规等。新生儿感染所致的黄疸要检查血常规、c反应蛋白、血培养等，同时要检查肝功能。
