先天性白内障的患儿，如果晶体混浊较为严重，出现皮质混浊、变白或晶体核心混浊，严重影响视力，应早期进行治疗。患儿应该在6个月左右行单纯性白内障手术治疗，以避免弱视等相关并发症的发生，影响患儿视力发育。
先天性心脏病的孩子，如果不及时治疗，会对身体造成很大的影响。不过，也有一些很轻的先天性心脏病，比如单纯的室间隔缺损、房间隔缺损，如果缺损很小，不会有什么特别的症状，三岁以内就会自然生长，不会对身体造成任何影响。如果是先天性心脏病，不能自己治愈，需要通过手术治疗，不然随着年龄的增长，病情会越来越严重。
主要是使用青霉素药物的方法进行治疗，治疗时药物剂量应足够，疗程应规律，不规律治疗是引起复发梅毒、隐性梅毒的重要原因，晚期隐性梅毒，可在早期隐性梅毒的基础上，增加一个疗程。
女儿患有先天性腮瘘通常应及时进行治疗。
先天性腮瘘是由于胎儿在发育过程中咽喉部导管没有闭合。由于伤口裸露在外面，容易发炎、化脓，长期以往很可能导致恶变，只有手术才能解决问题。如果是腮瘘，需要做碘油造影，或者用造影剂注射造影剂，做X线或CT检查，看看鳃裂囊肿有没有内瘘。一般情况下，鳃裂囊肿是有瘘管的，有外瘘的，也有内瘘的。在做手术之前，必须先确定有没有外瘘或者内瘘。术中应沿囊肿包膜切除囊肿，同时切除瘘管，封闭瘘口。
先天性的癫痫的治疗主要的应该用药物治疗才行的另外就是有一定的遗传性。结合病史，临床症状及脑电地形图诊断，可以是口服抗癫痫药物治疗的，注意监测癫痫血药浓度，控制癫痫平稳的可以看染色体有无异常的情况再考虑。
