如果咽喉部有囊肿，疼痛十分明显，可以考虑做纤维内镜手术进行摘除。但是如果是因为有合并急性的炎症，炎症消除之后，疼痛解除，可进一步观察囊肿，只要囊肿长大，就要手术，一定要到医院接受正规检查和治疗。平时生活中在饮食上也要多注意，不要食用过多的辛辣的刺激性食物。
通常对于囊肿的治疗来说，首先要彻底分清区分囊肿是属于良性还是恶性的。如果囊肿是良性的，没有必要担心了，可以通过口服一些中药进行保守治疗慢慢调养。但如果囊肿是恶性的话建议要尽早采用手术的治疗方式进行治疗，如果手术治疗方式效果不佳的话，还可以再生全身化疗的方式，这些方法就可以彻底治疗囊肿。如肾脏囊肿，若是4cm以上的肾脏囊肿，可以通过腹腔镜手术就可以治疗；4cm以下的肾脏囊肿，也可以通过B超定位下穿刺进行治疗。
要采用生理盐水来进行冲洗，同时还要局部应用消炎的药物来进行消炎，平时要注意局部的卫生，耳朵上面长了囊肿的话就是有脓性分泌物增多，考虑和细菌感染有很大的关系，可以采用切开的方法来进行引流，一般考虑和皮肤的损伤有直接的影响。
当发现肿肝囊肿时，应先看看B超单上面的结果，如果是单个小于5cm的肝囊肿，位于肝脏实质内，没有对肝脏内的主要大血管及胆管造成压迫，可以观察，可以每年复查超声，了解其生长状况。如果造成肝内大血管或胆管的压迫，就需要到正规医疗机构就诊，由肝胆外科医生评判病情，并提出治疗计划。
建议家长带孩子去医院做检查，一般较小的单纯肾囊肿生长缓慢，对肾功能的影响不大，只需要定期观察复查即可，但是对于直径超过4厘米的单纯肾囊肿或者囊肿，需要进行手术治疗。单纯肾囊肿需要手术治疗，第一种表现为腰腹疼痛不适或者心理压力过大。
二是囊肿直径大于4cm，或近期系统明显增大。
三是囊肿压迫，肾积水或囊肿引发出血、感染、破裂等病变。
四，有可能是癌症患者。
