皮下囊肿可能会癌变，但概率极小。
如果皮下囊肿患者有囊性畸形，那么恶性的可能性较大，一般都是良性的。皮下囊肿切除后需要做好组织切片检查，主要是皮脂腺囊肿，皮样囊肿，皮样囊肿等。通常情况下，头部、面部、筋、躯干等都需要外科手术，如果不是感染或者囊肿，可以完全切除。局部皮肤要不要切掉，要看与周边的肌肤情况。当然，部分缺损的皮肤是可以避免再次出现的，这要看其体积，如果是比较大的，可以尽可能的保存周边的肌肤。
身体有皮下脂肪瘤囊肿性的病症，也不疼痛或是没有什么不适的症状，可以不用治疗，观察一下就可以。如果有疼痛的症状，本症比较严重了，有长大的趋势，是这样，那就是进行积极治疗，治疗办法可以选择手术摘除治疗。脂肪瘤是体表最常见的软组织良性肿瘤，只有极少数会恶变。深部脂肪瘤有恶变可能，即变成脂肪肉瘤。因此，即使患病也不必过于紧张。
如果是单纯的皮下囊肿，没有合并感染。而且囊肿比较小，没有影响功能活动，可以暂时不进行治疗，如果增长比较快，可以进行手术治疗，如果皮下囊肿合并有感染，而且囊肿比较大，可以进行抗炎治疗，然后再进行手术切除。
通常情况下，皮下囊肿不会自行消退。
皮下囊肿是生长在皮肤部位的一种良性肿瘤，是否会消除要根据皮下囊肿的类型与囊肿的大小。如果皮下囊肿较小，可能在受到外力的刺激会自行溃败，随时间推移，囊肿会逐渐消退消失。但这种可能性比较小，大多数情况都不会自行消退的，如果是较大的皮下囊肿，一般都要经过手术治疗才能消退。因此，皮下囊肿能否自行消退，与囊肿的类型与大小有关。
可以将冰块放在冰袋里或者毛巾里，敷在太阳穴上方的疼痛处，然后等冷却的头部血管收缩之后，疼痛的症状会逐渐减轻。可以在光线比较暗或者四周环境安静的地方休息。
一般情况下，阴茎皮下囊肿应对症进行治疗，具体内容如下：
阴茎皮下囊肿是一种在阴茎的皮肤系带之上的囊性肿物，能够在一定的距离内被挤压、推动。通过B超检查通常能够确诊患者是否患有阴茎皮下囊肿。如果阴茎皮下囊肿体积不大，通常不会对患处的日常生活产生不良影响，患者可以选择进行保守的观察和处理。但是，如果阴茎皮下囊肿比较大，患者还伴有疼痛、肿胀等不适症状，这可能会影响到患者的日常生活，患者可以通过手术治疗来切除阴茎皮下囊肿。
