甲状腺异常治疗包括选择性放疗或药物治疗，手术治疗。
在许多情况下，甲状腺功能障碍需要治疗。甲状腺功能不全可分为多个病例，因为甲状腺功能检查不是指标。最简单的检测是TSH、FT3和FT4三个指标，需要根据不同指标进行不同的处理。甲状腺功能减退：TSH升高，FT3和FT4降低，原发性甲状腺功能减退常见。在这种情况下，是否需要治疗取决于TSH水平。甲状腺功能亢进症：TSH降低，FT3和FT4升高。常见的是原发性甲状腺功能亢进症，需要抗甲状腺功能亢进症药物治疗。若药物无用可采用碘-131治疗或手术切除部分甲状腺组织。TSH、FT3和FT4升高时，可能是垂体功能亢进。
可以通过药物治疗内分泌失调性不孕。
对于内分泌失调性不育的病人，可以通过服用一些有经验的中药来进行调理，中医讲究的是调节内分泌，让精血滋润身体，让血液循环，从而达到从内到外的效果。要针对具体的原因进行针对性的治疗，最好是到医院妇科、内分泌等科室进行全面的检查，比如性激素六项，从而确定最佳的治疗方案。
治疗内分泌紊乱可以通过以下方式来改善：
一应注意保持较愉快的状态，以免产生焦虑，沮丧等紧张状态。
二保持较好作息，早睡晚起，忌熬夜和过度疲劳。
三在饮食上注意多食蔬菜和水果，少食油炸和腌制以及脂肪和热量含量相对较高食品。
四是注意戒恶习，如吸烟，嗜酒，晚睡等恶习。
五为了确保相对适宜的重量，太瘦太胖特别是太胖还可能引起内分泌方面的失调。
甲状腺炎可导致内分泌失调现象。
甲状腺炎是由自身免疫异常、感染、药物和放射线等多种原因所致。建议病人应经常体检，甲状腺炎也可造成身体各脏器的损害，还可以导致贫血，高血压等情况，因此需要及时进行治疗。日常生活中，还要讲究饮食，多吃含新鲜蔬菜、水果，增加高蛋白、高热量食品，忌吃辣、油、生、冷、刺激性食品，比如海鲜、海带、海鱼。同时还要保持健康良好的心态，多饮水提高机体新陈代谢。
一般来说，甲状腺内分泌科以诊治甲状腺疾病为主。
甲状腺是脊椎动物非常重要的腺体，位于颈部甲状软骨下方，气管两旁。一般情况下，甲状腺内分泌科甲状腺肿、亚急性甲状腺炎、桥本甲状腺炎以及其他自身免疫性甲状腺疾病为主。
患者在日常生活中应当饮食清淡，不吃刺激性食物，多吃富含钙质的食物，不要吃刺激和油腻的食物，并加强身体锻炼，注意保暖。
内分泌科甲状腺检查，主要为甲状腺6项和甲状腺彩超检查，常见情况如下：
1、甲状腺激素6项不需要空腹。主要看看甲状腺激素有无分泌异常，例如有无甲状腺功能亢进症和甲状腺功能下降。如有甲状腺功能亢进，采血指标提示游离T3、T4升高、TSH降低，需抗甲状腺功能亢进药物治疗。
2、甲状腺彩超主要看甲状腺内有无结节或肿胀。甲状腺肿胀时，不需要特殊处理。如果甲状腺发现结节或肿瘤，肿瘤需要治疗手术。结节在3cm以内，同时无压迫症状，边界清晰，边缘清晰。这种情况只需观察，半年至一年去医院复查甲功和甲状腺彩超即可。
