新生儿接种乙肝疫苗需要在第一天接种第一针，第二针在30天内打第二针，180天打第三针。
现在普遍认为三次乙肝疫苗能够促进人体的免疫，从而降低乙肝病毒的感染几率，降低母亲的垂直传播的危险。不过，接种了乙型肝炎疫苗并不意味着就能得到保护的抗体，而保护性抗体的生成与自身的免疫力有关，因此需要在一周岁左右做一次血液检测，检测到乙肝两对半，以确定是否得到了保护的抗体，如果乙肝表面抗体为阴性则需要进一步接种。
新生儿接种乙肝疫苗的时间为出生后24小时内接种第一次，然后分别在1月龄、6月龄的时候再次接种，共3次。乙肝疫苗接种同样有一定的禁忌证，如携带乙肝病毒、对疫苗的成分过敏、患有神经系统疾病、重度营养不良、先天性免疫功能缺陷、正在使用免疫抑制剂等人群禁止接种乙肝疫苗。
结果表明，单用HBV抗体为阴性的儿童，不能有效地防止其它儿童的横向传染，只能通过普通接种来达到良好的预防作用。接种乙肝病毒的免疫覆盖率和免疫覆盖率是成正比的，接种范围和比率都会提高。
所以，开展乙肝疫苗免疫是减少乙肝感染的最好方法，同时也是防止乙肝感染的最佳途径。结果表明，要实现团体免疫，需要95%的接种覆盖率，才能实现目标的70.8%，而75%的接种覆盖率只有57.3%，低于75%的接种比例就会降低。
新生儿出生24小时内接种乙肝疫苗，常规的乙肝疫苗注射是016方案。
新生儿在出生24小时之内，要及时的接种第1针乙肝疫苗。如果出生24小时之后这种乙肝疫苗会影响到疫苗的预防效果。一个月和六个月的时候分别再注射后面的两针。若母亲是乙肝感染者，出生婴幼儿是低产儿、低体重儿在出生后更要加强一针，需分别在0、1、2、6个月注射乙肝疫苗。
新生儿接种乙肝疫苗是按出生后24小时内。新生儿体重低于2250克，满月后就持预防接种卡去接种。早点接种疫苗是为了新生儿不会感染结核和乙肝，不会有什么事情。在出生后一个月内就为婴儿接种疫苗，不要超过一个月，之后的要打的疫苗就是国家免疫程序里的乙肝、百白破、麻风、麻腮风、流脑之类的。
乙肝疫苗第2针一般在满月后接种，但是如果孩子有异常情况，比如发热，黄疸，流涕，咳嗽，腹泻等症状时，是不能接种疫苗的，因为会使病情加重，对孩子的身体健康造成损害，此时应该延期，积极治疗疾病，直到病情完全恢复时进行接种。
