较小的蛛网膜囊肿无需特殊治疗，只要定期复查观察囊肿的变化情况；如果囊肿有增大趋势或对周围脑组织构成压迫出现神经系统症状时则需手术治疗。手术可选择囊肿-腹腔分流术，但容易出现分流管梗阻、感染、终身带管等并发症。也可在内镜下微创手术行囊肿-脑池造瘘，后者损伤小，恢复快，费用低，且无需终身带管。随着内镜设备及技术的不断进步，后者已被越来越多的接受了。
蛛网膜囊肿是一种可以见于颅内和椎管内的囊性病变，因为产伤或出生后的颅内出血、颅内感染等因素，造成的蛛网膜粘连形成的囊肿，本身并不严重。如果囊肿体积较大，一般大于5cm以上，或引起头痛、癫痫、偏瘫、视力下降等，则需要行开颅囊肿切除术、神经内镜下囊肿切除或囊肿分流术。
颅内蛛网膜囊肿，临床中大多患者不会出现任何不适，所以不需特殊处理，如果引起临床症状如头痛、恶心、呕吐、癫痫、视乳头水肿等表现，这类蛛网膜囊肿就需要去除，去除方法主要是通过手术。
蛛网膜囊肿是先天性发育异常形成的，是否要手术治疗与囊肿的大小没有很大的关系，如果没有头痛等压迫症状，一般是不需要治疗的。如果有头痛等压迫症状，就需要手术治疗了。应该到正规的公立医院进行检查和治疗。病人要清淡饮食，避免剧烈运动。
蛛网膜囊肿手术成功率大概在百分之95以上。可以采取微创的手术方式进行治疗。从颅外进行定位，穿刺打眼，将一根管子伸到蛛网膜囊肿的地方进行抽吸，可以有效的减少蛛网膜囊肿。
蛛网膜囊肿较大就要进行手术治疗。术后要避免感染，要多吃有营养的食物及新鲜的瓜果蔬菜，不要吃辛辣刺激油腻的食品，不要抽烟喝酒，要多注意休息，不要过度劳累。如果没有其他症状出现，就不需要治疗，观察即可。
