一般情况下，艾灸肛门对直肠炎的治疗，能达到辅助治疗的效果。
直肠炎多由肠道内菌群失调、有害菌滋生引起，而艾炙通常无杀菌、消炎之功效，故艾灸无法直接用于直肠炎，只能起到辅助治疗的作用。直肠炎以药物治疗为主，在平时要注意生活作息规律，尽量不吃辛辣刺激性食物，不要滥用抗生素，以免对肠道正常菌群造成损害，这样才能控制直肠炎病情。
直肠炎可以灌肠治疗。将药物直接的作用的炎症的部位，可以快速的达到治疗的目的，再配合口服的药物一同治疗，这样可以达到快速恢复的目的。注意饮食清淡，多喝水，需要多休息。
临床表现为长期慢性、或反复发作的腹痛、腹泻及消化不良等症，重者可有粘液便或水样便。本病可由急性肠炎迁延或反复发作而来，病程多在2个月以上。长期过度疲劳、情绪激动、过度精神紧张，加以营养不良，都可成为慢性肠炎的诱因。也可继发于咀嚼障碍、胃酸缺乏、胃大部切除术后、肠道寄生虫病等疾患。
直肠炎反复患者可以口服氧氟沙星、甲硝唑、奥硝唑等药物治疗。
直肠炎患者除了要积极配合医生治疗以外，平时要养成良好的饮食习惯，注意饮食卫生，戒烟戒酒，避免浓茶浓咖啡，不能吃辛辣刺激性食物，注意腹部保暖。治疗期间患者要注意多休息，同时坚持清淡饮食，不要吃辛辣刺激性食物，比如火锅、冰可乐等，有利于身体恢复。
一般情况下，直肠炎患者建议及时就诊，明确病因后，对症治疗。比如细菌感染造成的感染型直肠炎，就需要用抗生素治疗等。具体分析如下：
通常来讲，对于细菌感染造成的感染型直肠炎患者，通常需要用左氧氟沙星等喹诺酮类抗生素进行治疗。需注意的是，患者用药之前需要做药敏试验。除此之外，还有部分患者是因为便秘、长期大便嵌顿引起的压迫性直肠炎，此时就需要先改善便秘的症状，患者除调整饮食结构外，可以服用乳果糖。需注意的是，所有药物要在医生指导下服用。