一般情况下，妊娠妇女都会使用一些抗菌药物来治疗疾病，如青霉素类、头孢菌素等。
抗生素对细菌性结膜炎有优良的疗效，对病毒性结膜炎的治疗虽然无效，但还有防止细菌感染。在怀孕期间，由于胎儿的不断发育，身体抵抗力会越来越弱，很容易受到病菌和病毒的侵害而引起炎症，导致眼部发炎或视力下降等症状。因此，孕妇患结膜炎的话，眼药水和眼药膏都要专人专用。另外，在用药时要注意避免使用刺激性药物和激素类眼药品种，因为激素有刺激眼部黏膜和结膜细胞生长等不良反应。
小儿结膜炎通常会出现严重的症状，主要是由于眼部肿胀、结膜充血、渗出、发热等。对于儿童的结膜炎，需要引起足够的注意。使用不含有任何防腐剂、不刺激性或不含任何防腐剂的滴眼液，例如：乳酸左氧氟沙星眼药水和利巴韦林眼药水。如果需要，可以服用一些抗菌药物。眼睛的分泌物要尽快清洗。在夜间使用红霉素的眼睛。要经常洗手，避免用手搓眼。要多摄入维生素丰富的食品，并且要有足够的睡眠。
一般来说，儿童过敏性结膜炎用抗炎抗过敏药。
过敏性结膜炎又称为变态反应性结膜炎，是结膜对外界变应原产生的一种超敏反应。可以使用抗炎抗过敏药物糖皮质激素如泼尼松眼药水、H受体阻滞剂如奥洛他定眼药水等来治疗，也可以吃扑尔敏来治疗。家长需要带孩子到眼科检查原因，然后对因对症治疗。家长要适当调整小儿的饮食结构，尽量以清淡为主。
得了结膜炎首先应明确是否有分泌物及分泌物的颜色。若为黄色黏腻分泌物，考虑结膜炎由细菌引起，可用眼药水等进行抗菌处理，若分泌物为水液性，考虑为病毒感染，可应用眼药水进行抗病毒治疗，儿童易患过敏性结膜炎同时伴有鼻炎症状，可进行眼部抗过敏治疗，若病情严重，可同时进行全身抗过敏治疗以缓解症状。
大多数婴儿结膜炎是由细菌、病毒或衣原体感染等病菌引起的。细菌感染结膜炎可用妥布霉素眼药水、泰利必妥眼药水。干扰素、阿昔洛韦。更昔洛韦等药物，可用于病毒感染引起的结膜炎。红霉素眼药水可用于衣原体感染引起的结膜炎。另外，如果是过敏性结膜炎，可以选择糖皮质激素类的眼药水，如色甘酸钠滴眼液、帕坦洛滴眼液等。具体用什么眼药水，建议带婴儿去医院做眼科检查，在医生指导下使用药物。
儿童结膜炎症状是眼睛充血发红和分泌物眼屎多。细菌性结膜炎黄白色眼屎多见，严重的眼睑肿胀，结膜充血发红水肿，乳头增生、淋巴滤泡形成假膜、耳前淋巴结肿大疼痛。病毒性结膜炎水样眼屎多见。过敏性结膜炎眼睛痒越揉越痒多见。在用药物治疗的同时，应注意儿童的护理，给儿童用专用毛巾、脸盆等。同时使用完应立即进行消毒处理。如果出现畏光刺痛感明显的情况，可以局部进行冷敷处理。
