直肠炎的治疗方法包括：1.一般治疗：适当休息，进清淡、少渣、营养丰富、无刺激性的食物，并做到心情愉快，劳逸结合；2.药物治疗：修复肠黏膜，缓解出血症状；3.穴位埋线：可长期刺激穴位，促进血液循环，加快炎症吸收，加速溃疡愈合。
局部治疗：直肠粘膜水肿者，可用生理盐水、0.5-1％鞣酸、1：5000溶液灌洗直肠。粘膜糜烂者，可涂以％醋酸可的松溶液或10％硝酸银溶液。括约肌、肛提肌痉挛者，可将温橄榄油注入直肠内。直肠粘膜萎缩变干者，可每晚于直肠内注入0.5％油适量。临床上，用蜂蜜、芝麻油各50-100毫升和黄霉液50-100毫升，隔一天交替保留灌肠，每天2次，有很好的疗效。
不能。应禁用肉汤、鱼汤、鸡汤以及过多的鲜味食品。可将肉类煮熟去汤后再烹制。食物要做得细、碎、软、烂。烹调的方法少采用煎炸等，尽量用蒸、煮、烩、炖与煨等。可喝牛奶、豆浆、吃馒头、面条、面包以中和胃酸。
因直肠距肛门较近，若经肠镜确诊为直肠炎，症状轻时，可使用药物治疗。如伴有溃疡性结肠炎，则要针对性治疗。若为放射性直肠炎，可加用保护剂，效果较好。若直肠炎症状较重，出现便血等症状，可辅助使用抗生素消炎治疗，甚至加用止血类药物。
肠炎通常会用一些方法减轻直肠黏膜水肿，口服一些药物，改变肠道的菌群，给予一些益生菌药物。医院肛肠科有些病人，采用把弥散的He-Ne激光导到直肠腔里，做黏膜照射也能够起到很好的治疗作用。
