治疗上首先应该注意营养，预防感冒，提高机体的免疫功能，积极治疗原发病。如果病情严重时，可以采取手术切除的方法进行治疗，在生活中同时也应该禁忌辛辣、刺激的食物，以免加重病情。
扁桃体肥大一般是慢性扁桃体炎导致的肥大增生，三度以下肿大，没有任何症状可以不治疗，如果有异物感，疼痛可以吃头孢拉定，甲硝唑，喷七味清咽气雾剂。急性扁桃体炎可以输青霉素，奥硝唑，用生理盐水漱口，一般治疗七天可以痊愈。
打呼噜是扁桃体肥大的一个主要症状，是由于肥大的扁桃体阻塞气道所致，严重的可以发展为睡眠障碍性呼吸暂停，导致夜间处于缺氧状态，长期的缺氧状态，使孩子夜间不能得到良好的休息，早上赖床，白天疲劳，脾气暴躁，容易烦躁，此外，频繁打呼噜的患儿出现多动症的几率比普通孩子高出4倍，这些孩子经常表现出上课注意力不集中，好动等。
扁桃体肥大由于慢性炎症刺激导致的炎症的刺激就会导致的，二度以下的扁桃体肿大是不需要处理的，对于三度以上的扁桃体肿大有可能会影响正常的呼吸，可以进行扁桃体的摘除，手术以后症状会得到明显的改善。
患者要充分抗感染治疗：一般可以口服抗病毒液或消炎药物口服治疗，来清除病患者的病原体。手术治疗：如果扁桃体多次发炎，药物治疗没有效果的，可以考虑手术切除扁桃体。
对于扁桃体肥大的孩子需要看扁桃体肥大的程度以及临床症状，如果是二度以下的扁桃体肿大多数情况下是不需要手术治疗，如果是三度的扁桃体肿大，每年反复化脓超过五次以上，并且夜间出现了憋醒、打鼾明显，影响了正常的呼吸，需要考虑手术切除。
