做肠镜检查时管子是从病人的肛门部位伸进去的，在伸入时，出了羞耻以外，病人还会产生明显的便意，会想排便，肚子胀得难受。在管子进入拐弯的点时，还会感觉到肚子痛。做胃镜检查时管子是从病人的嘴里插入的，病人会觉得恶心，想吐，窒息，喘不上气。在做胃镜检查的过程中，病人常常忍不住的流泪，流鼻涕，流口水。
胃肠胶囊镜检查时间需要根据检查所选择部位的不同来判断，具体分析如下：
胃肠胶囊镜检查是指检查的胶囊随着肠道的蠕动，走过全部消化道并记录。因为人体大肠和小肠的蠕动情况不一样，小肠一般需要四到六个小时，而大肠则需要二十个小时左右。所以胃肠胶囊镜的检查时间并不固定。
建议患者在检查期间，在医生的指导下，适当的促进肠道的蠕动。
也就是指胶囊内镜，通常由三部分组成胶囊内镜、数据记录仪、工作站。胶囊内镜摄取消化道图像后经传感器传送至数据记录仪，数据记录仪储存图像并上传图像数据至工作站，在工作站中，数据被处理为彩色的动态视频图像进行播放。主要用于不明原因消化道出血、小肠病变诊断，胃肠道梗阻、无手术条件以及严重动力障碍患者、体内心脏起搏器患者属于禁忌症。
开始进食主要是流质半流质饮食，如稀饭，面条等食物。可以就诊正规医院消化科进行胃肠及肠镜的检查，单纯的检查后需要禁食水2个小时，如果进行息肉或者腺瘤手术的治疗，禁食水的时间延长，其次如果是无痛的胃肠镜检查，需要禁食水4到6小时的时间。
无痛胃镜肠镜有危险，具体分析如下：
首先，就是麻醉的风险，虽然是速效麻醉剂，但如果用药不当，很可能会出现精神错乱、烦躁、缺氧缺血性脑病、植物状态、死亡等。另外，与普通胃肠镜相比，因为缺乏沟通，所以在手术中，肠镜会出现充气过多、进镜速度过快，从而增加肠穿孔和系膜的过度牵扯。这就要求有熟练的麻醉师和内窥镜医生配合，才能进行无痛胃肠镜检查。
胃镜和肠镜在一起做的话费用大概会600元-1000元，因为肠胃镜的检查分为普通和无痛两种，检查当天清晨要空腹，建议平常饮食选择清淡容易消化的食物，避免吃辛辣刺激和生冷食物。
