呼吸暂停综合征的治疗包括一般治疗、手术治疗
1、一般治疗：对因肥胖导致的患者，可进行减重治疗；而对因体位导致的，可改变卧姿以侧卧位睡姿来减少上气道阻塞情况。
2、手术治疗：适用于如鼻腔阻塞、咽腔狭小、悬雍垂肥大、扁桃体肥大等原因所致的患者，可以医生指导下通过采取鼻中隔或鼻腔手术、腭咽或咽腔手术、下颌骨前徙术等手术方式来进行治疗。
睡眠呼吸暂停综合症是一种睡眠呼吸停止的睡眠障碍，治疗首先需要改变生活型态及睡姿，还可以应用止鼾牙套，可以在睡觉时佩戴一个家庭呼吸机，最后还能用手术治疗。
睡眠呼吸暂停可使用以下治疗方法：
1、去正规医院查明病因，找到引起睡眠呼吸暂停综合征的主要原因，一些患有鼻窦炎，扁桃体肥大的患者，需要对症治疗才能缓解睡眠呼吸暂停的症状；
2、一些患者因为肥胖引起了睡眠呼吸暂停，这种情况需要运动减肥，通过减重的方式能够缓解病情；
3、轻中度患者也可以通过口腔矫治器来治疗睡眠呼吸暂停。
通常情况下，中枢性呼吸暂停的治疗方法有药物治疗、其他治疗等。
氨茶碱能直接舒缓呼吸道平滑肌，能促进支气管扩张，增加肺活量。对于有肾、肝功能不全、心力衰竭的患者，要慎重使用。另外催眠镇安剂，可以改善亚病人的睡眠，特别是在使用正压呼吸器时。常见的药物有地西泮、水合氯醛、佐匹克隆等。
其他治疗：可以进行持续的正压通气，改善睡眠结构，改善夜间呼吸停止和呼吸不足。如果需要长时间的持续治疗，可以在家里进行。
主要强调综合治疗为主，比如戒烟、戒酒，肥胖者要减轻体重，手术治疗针对于扁桃体腺样体肥大者，进行扁桃体、腺样体切除术。针对于鼻中隔偏曲、鼻息肉或者是鼻甲肥大者，可以进行鼻中隔成形术，鼻息肉或者鼻甲切除，以减轻症状。
睡眠呼吸暂停综合征的治疗，要根据发病原因制定不同的治疗方案，有吸烟史的患者一定要及时戒烟，因为吸烟能够引起呼吸道症状加重，而肥胖的患者要积极减重，通过运动的方式减轻体重。一些睡眠呼吸暂停综合症的患者，往往还伴有心脑血管方面的疾病，因此必须要按时服用药物，睡觉时尽可能采取右侧卧，这样能够减少上气道阻塞。