三个月宝宝咳嗽、鼻塞可能是呼吸道感染导致的，具体分析如下：
三个月宝宝咳嗽、鼻塞，可以判断存在呼吸道感染。常见的有打喷嚏、发烧、咳嗽、流鼻涕等症状。建议带着孩子到医院检查一下血常规和炎症指标，看是不是病毒感染引起的，还是细菌感染引起的。如果是病毒感染，可以服用一些抗病毒的药物。如果是细菌感染，可以服用抗炎的药物。要注意肺部感染，要做胸部X光检查。
一般情况下，婴儿鼻塞，主要是因为鼻子的粘膜发炎和肿胀。
鼻粘膜腺体的分泌会导致鼻腔内的分泌物增多。因为幼儿的鼻子还很年轻，鼻子的通路比成人要窄一些，鼻子上的任何一点肿大都会导致鼻塞。鼻粘膜在受多种原因的影响后，会导致鼻粘膜的肿大，特别是下面的鼻甲肿大。下鼻甲的肿胀会对鼻孔的通风有一定的影响。建议家长及时带婴儿去医院就诊，明确具体原因。
婴幼儿由于鼻部不舒服产生的鼻塞，一般与鼻炎是有联系的，是由于细菌感染到了鼻粘膜，就会使鼻腔内分泌物变多，从而出现鼻道狭窄而产生鼻塞的情况，一般可以进行消炎治疗，在饮食上也要注意，少吃辛辣刺激性的食物，以免使症状更加严重。
如果家长有感冒和流鼻涕的症状，家长应该及时去医院接受合理的治疗以控制症状和感染。如果感冒不持续，不仅症状继续混淆，而且感染将继续发展，主要是沿呼吸道，这可能加重支气管炎，甚至肺炎。家长应该立即到医院的儿科或呼吸科，根据情况积极治疗。
宝宝到晚上就鼻塞，可能是冷空气刺激所导致的，可以口服一些感冒药进行治疗，另外经常给宝宝测量体温，防止体温过高，如果体温超过38度，还可以口服一些退热药和消炎药联合治疗。
宝宝鼻塞，需要根据病情、病史特点去判断。普通感冒的鼻塞，通常一周左右，症状逐渐减轻直至自愈。当鼻塞持续时间过久时，需要警惕过敏性鼻炎的可能。这时需要结合其他的情况综合判断分析。例如宝宝伴随哪些其他的症状，如发热、清涕和黄涕。平时腹泻、或大便带血，患有湿疹或荨麻疹史等疑似过敏性情况时，则过敏性鼻炎的可能性较大。