除了激光治疗，冷冻治疗法也是尖锐湿疣的常用的治疗办法，方法就是用冷冻的方法可以使尖锐湿疣内部结冰，从而形成组织局部的高度水肿从而破坏疣体，冷冻治疗的最大好处就是局部可以不留痕迹。
冷冻的办法来治疗这样的病症是可以起到立竿见影的效果的，液氮是可以祛除皮肤表面疣体，但是治疗后需要注意避免皮肤感染，冷冻治疗就是通过极度冷冻的状态下，将细胞迅速杀灭，但是一次治疗可能不能完全除去病毒，术后需要抗病毒和免疫治疗等，治疗后保持创面清洁卫生一周内尽量不要沾水，避免皮肤感染术后一般的七天左右的时间就可以愈合了，所以术后这段时间里，得需要对手术的部位进行消毒处理，不能发生感染的情况，饮食上需要注意，是不要吃辛辣刺激性的食物，戒酒，清淡的饮食为主。
皮肤科冷冻治疗是医院皮肤科常用的一种物理疗法，是利用低温作用于病变组织，使病变组织坏死、脱落，以达到治疗的目的。目前，冷冻治疗所用的制冷剂主要为液氮，是一种无色、无味、透明的液体，温度约为-196℃。其治疗主要机理为骤然降温，使组织细胞内外形成冰晶，结构破坏而裂解。
一般情况下，液氮冷冻治疗传染性软疣、瘢痕疙瘩、慢性湿疹等疾病。
一般情况下，液氮冷冻通常可以用于治疗扁平疣、传染性软疣、慢性湿疹、神经性皮炎、扁平苔癣、瘢痕疙瘩、脂溢性皮炎等。而对冷冻治疗不耐受者、冷球蛋白血症、糖尿病伴下肢血液流通不良者需要慎用。在进行低温处理后，要注意保持伤口的干燥和清洁，同时不要让伤口接触水，以免伤口受到影响。
通常来说，冷冻治疗疣有效，具体分析如下：
对于疣体较小的寻常疣，如甲周疣等，也可以先进行冷冻，再进行刮疣治疗，这样可以增加临床治愈率。液氮冷冻可以让疣体在低温条件下坏死，再慢慢脱落，但冷冻后会出现水泡，这是冷冻的副作用，可以使用抗炎药膏来防止感染，这样就会慢慢消失。对于较大的疣体，最好采用激光疗法。
冷冻治疗后起水泡说明疾病仍在发作。尖锐湿疣尖锐湿疣主要是由于感染人类乳头瘤病毒以后引起的一种性传播疾病，潜伏期在3个月左右。临床主要表现为皮肤黏膜部位出现的多发性乳头瘤样或者疣状损害。在温度较低而干燥的部位损害常表现为小而扁平状，在湿热、潮湿的环境下表现为乳头瘤状。
