最主要的后遗症就是迟发性脑病，往往患者在治疗3到30天之后，再次出现昏迷，或者出现烦躁、肢体瘫痪、精神障碍等症状。因此，为了避免患者出现此后遗症，应及早发现、尽早治疗，高压氧治疗可明显减少迟发性脑病的发生。一氧化碳中毒是含碳物质燃烧不完全时的产物一氧化碳，经呼吸道吸入而引起中毒。
一氧化碳中毒轻度患者在治疗后可基本痊愈无明显后遗症，重度中毒患者可发生神经系统后遗症，常见如头晕、头痛、乏力、痴呆、震颤麻痹综合征、记忆力受损、注意力不集中、感觉运动障碍、周围神经病等。如治疗期间肺部出现严重感染还可导致心肺功能不全，遗留如抵抗力降低、哮喘、劳力性呼吸困难、心悸心慌、心脏神经官能症等。
如果中毒程度较深需要去吸氧，吸氧一个小时，连续几天，身体就能恢复，现在只是有轻微的头晕和恶心症状，还不能算是中毒了，但是确实是受到了一氧化碳的影响了，只需要打开窗户或是到户外呼吸新鲜的空气，避免更多的摄入一氧化碳就可以，其它没有什么特别的处理。
首先要脱离致病环境，让患者呼吸新鲜的空气，给予吸氧。如果呼吸比较微弱或者停止呼吸，要立即进行人工呼吸。要纠正缺氧，增加一氧化碳的排出，吸入新鲜空气，可以给予高压氧舱治疗，呼吸停止的患者要及早进行人工呼吸或者呼吸机维持呼吸。还要防治脑水肿，严重中毒之后脑水肿可以在24-48小时发展到高峰，因此脱水治疗很重要，可以用甘露醇、高渗的葡萄糖、利尿剂，甚至应用激素治疗。
后遗症主要表现为反应迟钝，表情呆板，行动迟缓，沉默少语，智力下降，记忆力差，大小便失控，意识障碍，表现为行为紊乱，语无伦次，哭笑无常，随意大小便，自言自语，定向力丧失等。
