骨髓穿刺主要适用于多种疾病的诊断，如多种贫血，有巨幼细胞贫血，地中海贫血，再生障碍性贫血等。骨髓穿刺后还需做病理检查，可以明确或排除骨髓纤维化、各型白血病、多发性骨髓瘤等疾病。
骨髓穿刺是一种普遍、常用的、安全的医疗方法。主要是对血液科疾病进行诊断以及治疗效果的评价。比如血常规中发现了血细胞的成分、比例、数量发生巨大的改变，就需要进行骨髓穿刺来进行确诊。在经过治疗以后，也需要经过骨髓穿刺的复查，来对治疗效果进行评价。骨髓穿刺是安全的，没有后遗症。
骨髓穿刺检查是血液系统疾病的重要检验方法。可以了解骨髓内各种细胞的生成情况，各种细胞的形态、成分的改变及发现异常的细胞等，以明确诊断，观察疗效，估计预后。
主要确定或排除的疾病有，再生障碍性贫血。白血病，骨穿不但能够确定或排除，而且可以确定白血病的类型。在周围血象不正常时，如红细胞白细胞血小板明显的增多或减少时，用骨穿来查明是否为骨髓造血的影响。
骨髓穿刺可以说是比较安全的，但是由于骨髓穿刺是一种创伤性的检查，而且穿刺针还得插入骨髓，抽取骨髓液，所以还是存在一定的风险的，比如可能会出现穿刺失败，出血，伤口感染，所以在做骨髓穿刺的时候是会进行局部的麻醉，以减少痛苦的。
