神经内分泌和神经递质：松果体-丘脑下部-垂体-肾上腺轴异常，导致5-HT、内啡肽增加，促肾上腺皮质激素(ACTH)分泌减少。免疫系统异常：发现T淋巴细胞数量减少，辅助T细胞和B细胞数量减少。
儿童孤独症，一般在3岁以前就会表现出来，其主要表现症状是不同程度的人际交往障碍、兴趣狭窄和行为方式刻板等，其中约有四分之三的患儿伴有明显的精神发育迟滞，部分患儿在一般性智力落后的背景下具有某方面较好的能力。
自闭症一般指的是孤独症。通常情况下，孤独症是遗传因素、孕产不良因素等原因造成的。具体情况分析如下：
1.遗传因素：孤独症主要是遗传导致的，孤独症的孩子的兄妹患有孤独症的机率是一般孩子的几百倍。
2.孕产不良因素：如果孕妇是高龄产妇，患有高血压、糖尿病等疾病，且在孕期有抽烟、酗酒或是被病毒感染等不良行为都有可能会导致孩子大脑受到损害，进而加大了患有孤独症的机会。
自闭症是神经系统失调导致的发育障碍，其病征包括不完整的社交能力、沟通能力、兴趣和行为模式，语言交流障碍语言发育落后，或者在正常语言发育后出现语言倒退，或语言缺乏交流性质。
轻微自闭症广泛性发育障碍的代表性疾病。
孤独症中的孤独性障碍与阿斯伯格综合征较为常见。孤独症的患病率报道不一，一般认为约为儿童人口的2～5/万人，男女比例约为3～4：1，男孩是女孩的3-4倍。临床症状主要有社会交往障碍，交流障碍，兴趣狭窄等。通常可以通过心理方法进行治疗，比如人际关系发展干预疗法、行为分解训练法等。
