小儿在腹泻时多少都伴有肠道菌群的紊乱，可服用一些肠道微生态制剂，或肠黏膜保护剂。肠道微生态制剂和肠黏膜保护剂可以帮助缩短腹泻病程，效果良好。婴儿腹泻治疗方法具体还要看孩子的病情。病症重则需要去医院就医。
吃头孢菌素类的药物有可能引起腹泻。头孢菌素类药物的不良反应中比较常见的就是胃肠道的不适症状，例如恶心、呕吐、上腹饱胀、食欲不振，甚至腹痛、腹泻等。
患者需要注意的是，长期或大剂量应用头孢菌素对于体质差的群体会杀死一部分正常的肠道细菌，导致肠道细菌菌群失调，从而引发腹泻。所以应在医生指导下使用头孢菌素，如果使用头孢后腹泻可以选用整肠生类药物就会缓解腹泻症状。
婴儿腹泻推拿的方法是按揉宝宝的足三里，以膝盖髌骨下方的凸起处为起点，向下四指宽胫骨外侧，用大拇指的指肚按揉这一点100-200下。也可以把手掌摊开，放在宝宝的腹部，逆时针轻揉50下左右，但一定要逆时针揉腹，顺时针揉腹则是调理便秘的。还可以让宝宝平躺在床上，用一手的食指、中指、无名指并拢，用三指指腹在宝宝腹部绕圈按摩。以腕关节连同前臂作顺时针或逆时针方向环形移动摩擦，每次3-5分钟。
新生儿如果出现腹胀，同时又拉肚子，家长朋友直接带着宝宝到医院找专科的医生进行治疗。因为在宝宝出现腹胀的情况下，如果同时合并腹泻，我们可能考虑这个宝宝存在肠炎。对于新生儿来说，他的肠道非常薄且娇嫩，如果出现肠炎，病情进展较快，有时过久的观察或者在家里治疗起不到作用，反而会耽误宝宝的治疗。
腹泻婴儿可分为两类，即感染性肠炎和消化不良。首先，你需要去医院做常规大便检查。如果大便有炎症，你应该考虑肠炎并使用抗炎药物来控制感染。如果婴儿年龄较小，且反复肠炎，也应考虑乳糖不耐受或肠道过敏的可能性。
