治疗时间一般在三年左右，口腔苔藓的发生主要和精神状态压力过大，内分泌功能紊乱有关，对于扁平红苔藓需要及时的应用激素类药物进行治疗，如果不得不到及时的治疗，有可能会发生癌症变的危险。可以吃口服药来改善缓解症状，在平常的时候养成良好的饮食卫生习惯，多吃蔬菜水果，不要吃口味较辣刺激的食物。
口腔扁平苔藓目前还不能完全根治，可以通过药物治疗，调整心态，治疗全身性疾病，平时要注意口腔卫生，消除不良刺激，牙齿残冠残根，注意饮食清淡，多吃新鲜蔬菜水果，不吃刺激性食物。
口腔扁平苔藓可以通过冷冻治疗。伴有不同程度粘膜红斑充血，发生于苔藓斑纹中间或周围，界限一般清晰，表明病情处于活动期。即病情活动期，粘膜轻度发红，界限清晰。可波及整个粘膜，而白色病损反而轻微，有时需仔细辨认才能分辨出，可发生于颊、唇部。
没有特效药，口腔扁平苔藓的病因通常不清楚。人们普遍认为它是一种身体和精神疾病，即一种与精神有关的疾病，因为它容易使女性病人更年期。也有一些相关的研究，例如，它被认为与某些细菌的感染或其他疾病如肝炎和甲状腺炎有关。
口腔部位的扁平苔癣在2年时间，自愈是有的。但是这种自愈倾向，概率并不是特别的大。很多人在2年之内就算是消退了，很快也会再一次出现，主要是自身的扁平苔癣病因没有祛除，所以导致的这种情况。
口腔扁平苔藓2年能自己恢复，但是概率并不是特别的大。口腔扁平苔藓主要是由于自身免疫系统缺陷引起的一种疾病，表现皮肤上有扁平面有光泽的小丘疹，丘疹大小不等，边缘清楚，质地坚硬。
