先天性软骨发育不良应该通常可以采用以下方式进行治疗：
1.如果患者没有明显的临床表现，可以做屈伸运动抵抗电阻练习，主要是加强手指和脚部的肌肉功能，加强肌肉的强度和指脚趾的稳定。
2.如果病变局限，可以通过刮除移植来预防局部复发和恶性变，病变部位是长骨，恶性程度高，需要进行局部骨块或骨段的切除，以免出现恶性变化。
先天性软骨发育不良需要根据病变部位选择不同的治疗方法。如果头部发育不正常，要及时服用钙制剂和维生素D片。如果是胸骨部位的发育异常，这种现象是较为常见的，多会出现胸腔发育较小，胸椎向后凸等现象。还可能表现为手指粗大，下肢长短不一，逐渐出现四肢发育异常，应及时到专业康复机构进行牵引治疗，防止病症加重，影响身体健康。
一般来说，软骨发育不良应该采取以下方式进行治疗。
出现软骨发育不良的情况，患者可以遵医嘱口服钙尔奇类钙剂、氨糖类药物进行治疗，起到促进软骨修复的作用。必要时，患者可以通过关节镜下用髓内钉进行微创手术治疗，从而帮助修复。如果是染色体显性遗传引起的，可以适当应用生长激素进行治疗。必要时，可以做截骨手术达到根治的目的。
雾化吸入等治疗方式来进行治疗的。喉软骨发育不良的支气管炎需要到医院做微量元素检查，如果是缺钙导致的，可以通过适当的补钙来进行治疗。在补钙的过程中要多做一些户外活动，避免太阳晒黑，有利于钙的吸收，有利于软骨的生长。这种情况并不严重，通常在2-3岁时就会自行恢复。如果出现了比较严重的咳嗽，要做气管切开，以免出现呼吸困难。
先天性喉软骨发育不良主要表现是指哭闹有吸气性喘鸣，伴有呼吸困难，三凹征。轻症的宝宝没有症状，对发育和营养没有影响，主要是给宝宝补充钙，一般至2～3岁常能自己好。平时注意预防受凉及受惊，以免发生呼吸道感染和喉痉挛，加剧喉阻塞。如发作较重，吸气困难，可调整婴儿体位，取侧卧位可减轻症状，偶有严重喉阻塞者，需行气管切开术。
先天性喉软骨发育不良是一种自限性的疾病。治疗的轻重在很大程度上决定。以补钙为主，避免仰卧刺激及胃食管返流。对于严重的先天性喉软骨发育不全或无法自行愈合的儿童，应行外科手术。
一、一般治疗以补钙为主，避免仰卧刺激及胃食管返流。对于营养不良，生长缓慢，已知有胃食道返流的婴幼儿，可以使用含抑酸剂和高卡路里的食物。
二、对于先天性喉软骨发育不良的药物治疗，目前还没有药物治疗。
